基于功能宏基因组学挖掘抗生素耐药基因研究进展北大核心CSCD |
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引用本文: | 鲁兆祥,王夕冉,连新磊,廖晓萍,刘雅红,孙坚.基于功能宏基因组学挖掘抗生素耐药基因研究进展北大核心CSCD[J].生物技术通报,2022(9):17-27. |
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作者姓名: | 鲁兆祥 王夕冉 连新磊 廖晓萍 刘雅红 孙坚 |
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作者单位: | 1.华南农业大学兽医学院510000;2.国家兽医微生物耐药性风险评估实验室510000;3.岭南现代农业科学与技术广东省实验室510000; |
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基金项目: | 国家自然科学基金重点项目(31730097);国家自然科学基金青年科学基金项目(32102720);广东省普通高校创新团队项目(2019KCXTD001)。 |
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摘 要: | 随着各类抗生素被广泛用于治疗细菌感染以及抗生素在临床上的大量使用,驱动了各类抗生素耐药基因的不断进化,导致了耐药问题日趋严重。耐药基因与耐药细菌的广泛传播与普遍流行严重威胁公共卫生体系并引起了巨大的经济损失。值得注意的是,抗生素的广泛施用不仅造成了动物体内耐药细菌的产生,还提高了对环境中微生物的选择压力,间接推动了耐药基因的发展与进化,使环境微生物成为耐药基因新的储库。因此对耐药细菌的广泛监测与新型耐药基因的提前发掘具有重要的临床意义与研究价值。但是传统的耐药性调查手段过度依赖对耐药细菌的培养,难以全面的展现固定生态位中微生物耐药性的全貌。而功能宏基因组学技术利用其表型筛选和高通量测序相结合的优势,不依赖于对携带目标基因的特定细菌的培养,因此在发掘新型功能基因方面有着巨大的优势。本文综述了功能宏基因组在抗生素耐药方面的研究进展,讨论了功能宏基因组学方法在检测新型基因研究中的意义及存在的问题,为后续深入开展对抗生素耐药机制的探究提供了坚实的理论基础。
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关 键 词: | 功能宏基因组学 环境微生物 新型耐药基因 抗生素 |
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