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| 肠道病毒71型安徽、河南株的分离与VP1序列进化分析 | |
| 引用本文： | 邵强,杨全中,冯真真,于翔,苏志国.肠道病毒71型安徽、河南株的分离与VP1序列进化分析[J].生物技术通报,2011(3). |
| 作者姓名： | 邵强 杨全中 冯真真 于翔 苏志国 |
| 作者单位： | 1. 河南师范大学生命科学学院,新乡,453007 2. 华兰生物工程股份有限公司,新乡,453000 3. 中国科学院过程工程研究所,北京,100190 |
| 基金项目： | 河南省基础与前沿技术研究计划项目(082300450300) |
| 摘 要： | 旨在研究手足口病患者中肠道病毒71型分离株的病毒基因型特征。采集手足口病患者的粪便标本,进行病毒分离和逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)特异性扩增进行鉴定,同时选取其中9株EV71分离株,对其抗原决定簇部位VP1区进行核酸序列测定,并参考EV71 A、B、C各基因型的参考株和以往中国EV71的分离株进行同源分析和构建系统发生树。结果显示,所分析的9株病毒株均为C4亚型,3株安徽株H7、H8和H9的VP1序列相似度很高(≥98.8%,其中H7、H9的相似度为100.0%),4株河南株H3、H4、H5和H6相似度较高(≥98.4%,H3、H4和H5≥99.6%,其中H3、H4的相似度为100.0%),它们同河南株H1、H5的相似度也较高(≥97.2%),河南株H2虽然与其他河南株具有较高的序列相似度,但进化分析表明,其与安徽株同源性较高。结果表明,安徽株H7、H8和H9株变异速率明显加快,这可能导致了手足口病在安徽省的率先爆发与大流行,河南株H2最初可能由安徽传入河南。 |
| 关 键 词： | 肠道病毒71型 基因型 手足口病 同源性 系统进化分析 |
Sequence Analysis of VP1 Region of Enterovirus 71 Strains |
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| Shao Qiang,Yang Quanzhong,Feng Zhenzhen,Yu Xiang,Su Zhiguo.Sequence Analysis of VP1 Region of Enterovirus 71 Strains[J].Biotechnology Bulletin,2011(3). | |
| Authors: | Shao Qiang Yang Quanzhong Feng Zhenzhen Yu Xiang Su Zhiguo |
| Institution: | Shao Qiang1 Yang Quanzhong1 Feng Zhenzhen1 Yu Xiang2 Su Zhiguo3(1College of Life Sciences,Henan Normal University,Xinxiang 453007,2Hualan Biological Engineering Inc.,Xinxiang 453000,3Institute of Process Engineering,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100190) |
| Abstract: | |
| Keywords: | Entervirus 71 Genotype Hand-foot-and-mouth disease Holmology Phylogenetic analysis |
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