基于RNA-Seq技术分析江西豆豉对肠上皮细胞基因差异表达的影响

目的：基于RNA-Seq研究江西传统特色豆豉与肠上皮细胞的相互作用。方法：Caco-2细胞与豆豉水提样共孵育后，采用RNA-Seq筛选差异表达基因，进行KEGG、GO和PPI网络分析。结果：筛选差异表达基因17 892个，其中显著性240个，含上调表达125个、下调表达115个。KEGG功能注释215个信号通路，主要富集在新陈代谢、免疫系统、细胞调控、细胞粘附等类别。GO分析主要涉及免疫应答、细胞结构及功能调控、营养素代谢、神经传导及激素分泌调节等生物学过程。PPI网络分析在STRING数据库内有效注释的204个基因编码的蛋白互作，其中IL8、VCL、NFKBIA等节点度较高。结论：江西传统特色豆豉可引起肠上皮细胞多类基因差异表达，为阐明豆豉对肠道健康作用的分子机制提供科学依据。