牦牛HSFY基因的克隆及其结构分析 |
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引用本文: | 曾贤彬,王永,刘仲娜,马志杰,海汀,钟金城.牦牛HSFY基因的克隆及其结构分析[J].生物技术通报,2013(7):82-88. |
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作者姓名: | 曾贤彬 王永 刘仲娜 马志杰 海汀 钟金城 |
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作者单位: | 西南民族大学动物遗传育种学国家民委——教育部重点实验室;青海大学畜牧兽医科学院 |
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基金项目: | 国家科技支撑计划课题(2012BAD13B06);西南民族大学研究生创新科研项目(CX2013SZ65);中央高校基本科研业务费专项资金项目(11NZYTH03) |
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摘 要: | Y染色体上的热休克转录因子(HSFY)是精子发生障碍的候选基因之一。通过克隆牦牛HSFY基因,并与普通牛Y染色体上的84条HSFY序列比对。结果表明:牦牛HSFY基因由2个外显子和1个内含子组成,与普通牛基因组中的相应序列的一致性高达99.54%。牦牛、普通牛的该基因具有4处插入/缺失,且序列与其相邻序列极为相似。在1 012-1 020 bp(Ⅰ)处有AAAGAAGA/TG等9个核苷酸缺失,位于内含子内;在1 071-1 073 bp(Ⅱ)、1 249-1 251 bp(Ⅲ)处分别有AAG、CCA/C等3个核苷酸缺失,位于第二外显子内,分别导致赖氨酸和组氨酸的缺失;在1 708-1 710 bp(Ⅳ)处有CAA 3个核苷酸缺失,位于3’末端非编码区。在普通牛的84条HSFY基因序列中Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ插入/缺失分别有29、3、2、1次。未发现Ⅱ、Ⅲ同时缺失的拷贝,但Ⅱ、Ⅲ缺失均伴有Ⅰ缺失,且导致了蛋白三维结构的变化。牦牛HSFY是在睾丸中表达的多拷贝基因,经密码子偏好性分析,该基因编码的蛋白质偏好使用以A或T结尾的密码子。
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关 键 词: | 牦牛 HSFY 插入/缺失 精子发生 |
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