| 黄颡鱼微卫星标记的筛选及三个野生群体的遗传结构分析 |
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| 引用本文： | 吴勤超,梁宏伟,李忠,呼光富,罗相忠,沈子伟,邹桂伟.黄颡鱼微卫星标记的筛选及三个野生群体的遗传结构分析[J].生物技术通报,2010(3). |
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| 作者姓名： | 吴勤超 梁宏伟 李忠 呼光富 罗相忠 沈子伟 邹桂伟 |
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| 作者单位： | 1. 华中农业大学水产学院,武汉,430070;中国水产科学研究院长江水产研究所,农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室,荆州,434000;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,无锡,214081
2. 中国水产科学研究院长江水产研究所,农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室,荆州,434000;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,无锡,214081 |
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| 基金项目： | 国家科技基础条件平台专项，中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目 |
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| 摘 要： | 为了探明长江中上游流域黄颡鱼野生群体的遗传多样性状况和遗传结构,本研究采用磁珠富集法筛选出10个黄颡鱼微卫星标记,并利用其对长江中上游流域3个黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidrac)野生群体(赤水群体、乐山群体、洞庭群体)的遗传结构进行分析。获得65个阳性克隆并测序,得到36个含有微卫星的序列,设计并合成了22对微卫星引物,经筛选得到10对多态性稳定的引物,其中高多态性位点6个,中多态位点3个。每对引物等位基因数2-9个,平均4.8。3个群体(赤水、乐山和洞庭)的平均多态信息含量(PIC)分别为0.5438、0.4568和0.3965,平均有效等位基因(Ne)分别为2.9928、2.5401和2.1713,平均期望杂合度(He)分别为0.6280、0.5277和0.4757,表明这3个群体遗传多样性水平较高,其中赤水群体遗传多样性最高,洞庭群体最低。种群分化指数(Fst)和遗传距离(Ds)分析表明,洞庭群体和乐山群体之间的亲缘关系最近,而与赤水群体的亲缘关系最远。聚类分析显示,乐山群体和洞庭群体聚为一支,赤水群体单独聚为一支。
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| 关 键 词： | 黄颡鱼 微卫星标记 群体遗传 遗传多样性 |
Isolation of Microsatellite Makers in the Yellow Catfish and Its Application in Genetic Structure in Three Wild Populations |
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| Wu Qinchao,Liang Hongwei,Li Zhong,Hu Guangfu,Luo Xiangzhong,Shen Ziwei,Zou Guiwei.Isolation of Microsatellite Makers in the Yellow Catfish and Its Application in Genetic Structure in Three Wild Populations[J].Biotechnology Bulletin,2010(3). |
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| Authors: | Wu Qinchao Liang Hongwei Li Zhong Hu Guangfu Luo Xiangzhong Shen Ziwei Zou Guiwei |
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| Institution: | Wu Qinchao1,2,3 Liang Hongwei2,3 Li Zhong2,3 Hu Guangfu1,3 Luo Xiangzhong2,3 Shen Ziwei2,3 Zou Guiwei1,3(1 College of Fisheries,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,2 Key Lab of Freshwater Biodiversity Conservation , Utilization,Ministry of Agriculture,Yangtze River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Jingzhou 434000,3 Freshwater Fisheries Research Center,Wuxi 214081) |
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| Abstract: | In order to explore the genetic diversity and genetic structure of yellow catfish(Pelteobagrus fulvidraco)in different areas along the middle-upper reaches of the Yangtze River,we had developed ten polymorphic microsatellite markers using FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences containing repeats)magnetic beads method,and used them to evaluate genetic variation in three geographic populations of yellow catfish(Chishui Leshan and Dongting)along the middle-upper reaches of the Yangtze River.65 positive clo... |
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| Keywords: | Yellow catfish(Pelteobagrus fulvidraco) Microsatellite marker Population genetics Genetic diversity |
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