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猪源冠状病毒TGEV中国分离株纤突蛋白生物信息学分析
引用本文:李建强,柳纪省,程杰,兰喜,殷相平,李宝玉,李学瑞,杨彬,娄忠子,吴润.猪源冠状病毒TGEV中国分离株纤突蛋白生物信息学分析[J].生物技术通报,2009(4).
作者姓名:李建强  柳纪省  程杰  兰喜  殷相平  李宝玉  李学瑞  杨彬  娄忠子  吴润
作者单位:1. 中国农业科学院兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,兰州,730046;甘肃农业大学动物医学院,兰州,730070
2. 中国农业科学院兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,兰州,730046
3. 甘肃农业大学动物医学院,兰州,730070
基金项目:国家重点基础研究发展规划(973计划) 
摘    要:以猪源冠状病毒(Porcine coronavirus) TGEV 纤突蛋白基因序列为基础,利用生物软件对TGEV中国分离株纤突蛋白进行N-糖基化位点、跨膜螺旋、进化树、二级结构及抗原位点的预测和分析.结果显示所有TGEV毒株可分为3个基因型,4株中国分离株分别归属于以上3个基因型,属于Ⅰ型的中国株TSX在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上与其他中国株有明显的差异,而同属于Ⅲ型中国毒株SC-Y和TH- 98在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上非常接近,而所有中国分离株抗原表位没有明显差别,表明TGEV在中国没有显著的变异.

关 键 词:猪源冠状病毒  猪传染性胃肠炎  纤突蛋白  生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Spike Protein Gene of Porcine Coronavirus
Li Jianqiang,Liu Jixing,Cheng Jie,Lan Xi,Yin Xiangpin,Li Baoyu,Li Xuerui,Yang Bin,Lou Zhongzi,Wu Run.Bioinformatics Analysis of Spike Protein Gene of Porcine Coronavirus[J].Biotechnology Bulletin,2009(4).
Authors:Li Jianqiang  Liu Jixing  Cheng Jie  Lan Xi  Yin Xiangpin  Li Baoyu  Li Xuerui  Yang Bin  Lou Zhongzi  Wu Run
Abstract:
Keywords:
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