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鲤春病毒糖蛋白(G)基因的分离及同源性比较
引用本文:耿波,孙效文,牟振波,梁利群,欧阳红生.鲤春病毒糖蛋白(G)基因的分离及同源性比较[J].生物技术通报,2006(Z1):450-454.
作者姓名:耿波  孙效文  牟振波  梁利群  欧阳红生
作者单位:1. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,哈尔滨,150070;吉林大学,长春,130062
2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,哈尔滨,150070
3. 吉林大学,长春,130062
基金项目:中国水产科学研究院冷水性鱼类增养殖重点实验室开放课题“冷水性鱼类病毒病原的研究与鉴定”,农业科技跨越计划“优质冷水性鱼类健康养殖技术示范”(2004跨21)项目的资助
摘    要:通过RT-PCR和巢氏PCR方法从疑似鲤春病毒(SVCV)侵染的镜鲤肝组织中获得了鲤春病毒糖蛋白(G)基因。通过序列测定与分析,所获得的鲤春病毒糖蛋白(G)基因由606个核苷酸组成,编码一个由202个氨基酸组成的糖蛋白。通过NCBIblast与9个来自不同国家或地区的鲤春病毒糖蛋白(G)基因序列比对分析,发现获得的鲤鱼春季病毒糖蛋白G基因DNA序列与美国分离的AY527273株同源性最高为99.8%,与中国分离的AY842485株同源性次高为98.7%,与英国分离的两个序列SVI538065和SVI538066株的同源性为98.2%,而与其它国家的分离株如SVU18101、SVI318079、SVI538061、SVI538062、SVI538063的同源性最差,仅为89.4%~90.0%。氨基酸同源性分析结果与DNA同源性分析结果一致,所获得的鲤春病毒糖蛋白G基因氨基酸推导序列与其它9个分离株的氨基酸同源性在89.6%~99.5%之间。对SVCV不同分离株遗传变异和进化关系的分析为下一步开展SVCV快速诊断方法的研究和疫苗的研制奠定了基础。

关 键 词:鲤春病毒病  糖蛋白  序列同源性  分离株

The Isolation of Glycoprotein G gene of Spring Viraemia of Carp Virus and the Comparation of Sequence Homologous
Geng Bo,Sun Xiaowen,Mu Zhenbo,Liang Liqun,Ouyang Hongsheng.The Isolation of Glycoprotein G gene of Spring Viraemia of Carp Virus and the Comparation of Sequence Homologous[J].Biotechnology Bulletin,2006(Z1):450-454.
Authors:Geng Bo  Sun Xiaowen  Mu Zhenbo  Liang Liqun  Ouyang Hongsheng
Abstract:
Keywords:Spring viraemia of carp virus(SVCV) Glycoprote in Sequence homologue Isolate
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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