| 穿心莲ent-柯巴基焦磷酸合酶基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 姚攀,陈慧芝,李竹君,何瑞,杨锦芬,徐晖.穿心莲ent-柯巴基焦磷酸合酶基因的克隆与生物信息学分析[J].生物技术通报,2012(10). |
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| 作者姓名： | 姚攀 陈慧芝 李竹君 何瑞 杨锦芬 徐晖 |
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| 作者单位： | 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心,广州510006;岭南中药资源教育部重点实验室广州中医药大学,广州510006 |
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| 摘 要： | 旨在克隆穿心莲CPS的编码基因,并进行序列分析.通过RT-PCR和cDNA末端快速扩增的技术从穿心莲叶片中获得目的基因；并利用生物信息学的方法对其编码蛋白进行功能分析.结果显示,获得了全长2 499 bp的cDNA序列,编码一个833aa的蛋白.序列同源性比较表明,该蛋白与野甘草、咖啡等其他植物来源的CPS具有较高的同源性.保守功能结构域分析显示,该蛋白包含一个富含Asp残基的植物萜类合酶的共有保守功能域“DXDD”,归属于萜类生物合成酶Ⅰ类超级家族和顺式聚异戊二烯焦磷酸合酶超级家族.初步推测克隆得到了穿心莲CPS的编码基因(命名为ApCPS,GenBank登录号为JN216843.1).
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| 关 键 词： | 穿心莲 穿心莲内酯 ent-焦磷酸古巴酯合成酶(CPS) 基因克隆 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of a cDNA Encoding a Putative ent-Copalyl Diphosphate Synthase from Andrographis paniculata ( Burm. f.) Nees |
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| Yao Pan
,
Chen Huizhi
,
Li Zhujun
,
He Rui
,
Yang Jinfen
,
Xu Hui.Cloning and Bioinformatic Analysis of a cDNA Encoding a Putative ent-Copalyl Diphosphate Synthase from Andrographis paniculata ( Burm. f.) Nees[J].Biotechnology Bulletin,2012(10). |
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| Authors: | Yao Pan Chen Huizhi Li Zhujun He Rui Yang Jinfen Xu Hui |
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