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| 罗氏沼虾SSR标记再开发及其影响因素初探 | |
| 引用本文： | 戴习林,邓平平,施永海,何安元,蒋飞,丁福江.罗氏沼虾SSR标记再开发及其影响因素初探[J].生物技术通报,2012(10). |
| 作者姓名： | 戴习林 邓平平 施永海 何安元 蒋飞 丁福江 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306 2. 上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;上海市水产研究所,上海200433 3. 上海市水产研究所,上海,200433 4. 上海申漕特种水产开发公司,上海,201516 |
| 基金项目： | 科技部科技人员服务企业行动项目，上海市教育委员会重点学科建设项目，上海科委重点攻关计划项目 |
| 摘 要： | 在NCBI的Nucleotide数据库中检索到592条罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)基因组序列,其中含有SSR( simple sequence repeats)的序列占总数的16.39％,重复基元共有29种,以二核苷酸重复类型和三核苷酸重复类型为主,出现频率分别为14.02％和6.08％.整理G-SSRs序列并设计44对引物,以罗氏沼虾上海地方种群样本DNA为模板,对设计引物进行筛选,有32对引物的扩增产物条带比较清晰,占所设计引物总数的72.72％.用初步筛选得到的26对设计引物和已报道的37对SSR引物对罗氏沼虾江苏、广西以及上海地方种群进行引物的多态性筛选,分别得到9对和7对多态性引物.结果表明,种群的不同、序列的筛选和引物的设计直接影响到获得多态性引物的数量. |
| 关 键 词： | 罗氏沼虾 基因组 微卫星 引物设计 筛选 |
A Preliminary Study on Re-developing of Macrobrachium rosenbergii Microsatellite Markers and Influence Factors |
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| Dai Xilin , Deng Pingping , Shi Yonghai , He Anyuan , Jiang Fei , Ding Fujiang.A Preliminary Study on Re-developing of Macrobrachium rosenbergii Microsatellite Markers and Influence Factors[J].Biotechnology Bulletin,2012(10). | |
| Authors: | Dai Xilin Deng Pingping Shi Yonghai He Anyuan Jiang Fei Ding Fujiang |
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