| 基于二次判别的果蝇启动子识别 |
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| 引用本文： | 林昊,李前忠.基于二次判别的果蝇启动子识别[J].生物物理学报,2006,22(5):345-350. |
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| 作者姓名： | 林昊 李前忠 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021 |
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| 摘 要： | 通过对果蝇polⅡ启动子和非启动子的序列特征分析,计算了序列每个位点单碱基保守性M1(l)值和六联体保守性M6(l)值。从而分别选取两个区域的六联体频数作为离散源参数,利用离散增量结合二次判别函数(IDQD)对启动子进行了预测。对于从编码区和内含子中选取的非启动子数据集,启动子的预测成功率分别达到93%和89%。比较结果显示IDQD模型能够有效地提高启动子预测成功率。
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| 关 键 词： | polⅡ启动子 离散增量 二次判别函数 六联体 |
| 收稿时间： | 2006-03-06 |
| 修稿时间： | 2006年3月6日 |
A Model for Drosophila melanogaster Promoter Prediction |
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| LIN hao,LI Qian-zhong.A Model for Drosophila melanogaster Promoter Prediction[J].Acta Biophysica Sinica,2006,22(5):345-350. |
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| Authors: | LIN hao LI Qian-zhong |
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| Institution: | Laboratory of Theoretical Biophysics, Department of Physics, College of Sciences and Technology, Inner Mongolia University Hohhot 010021, China |
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