| 甲型H1N1流感病毒HA蛋白抗原表位及受体结合位点突变特性的对比研究 |
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| 引用本文： | 王舒宁,李国庆,吴迪,曹志伟.甲型H1N1流感病毒HA蛋白抗原表位及受体结合位点突变特性的对比研究[J].生物物理学报,2012(6):486-498. |
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| 作者姓名： | 王舒宁 李国庆 吴迪 曹志伟 |
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| 作者单位： | 华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室;上海生物信息技术研究中心 |
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| 基金项目： | “973”计划项目(2010CB833601);教育部“新世纪优秀人才计划”项目(NCET-08-0399)~~ |
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| 摘 要： | 人群中流行的H1N1病毒按其来源可分为两类:人感染的猪H1N1病毒与人类季节性H1N1流感病毒。这两类病毒在流行频率、易感性和致病性等方面存在明显差异。文章收集了1918～2009年间17株人感染的猪甲型H1N1毒株以及21株季节性H1N1毒株,通过序列比对、氨基酸残基保守性分析及3D结构对比等生物信息学方法,揭示造成这两类病毒流行病学和感染性差异的机制。研究发现这两类病毒HA蛋白的进化路径并不相同,且两者具有不同的突变特征,人感染的猪H1N1病毒中,Ca1、Ca2、Sa和Sb四个位点均较为保守,仅Cb位点的突变较快;季节性H1N1病毒仅有Ca1位点较为保守,其他四个抗原性位点均具有较快的突变速率,且较多的突变为新类型的氨基酸。另外,对受体结合位点的研究也显示,这两类病毒的该区域存在5个氨基酸水平的差异(ALA138SER、GLN192LYS、GLN196HIS、ALA198GLU和ALA227GLU),这些位点的差异使得人感染的猪H1N1流感病毒比人类季节性H1N1病毒的易感性更强。这些研究结果可为阐明两类H1N1流感病毒感染性及致病性差异提供更多的信息,并有助于进一步认识H1N1流感病毒的进化机制。
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| 关 键 词： | H1N1流感病毒 抗原表位 受体结合位点 生物信息学研究 |
Mutation Feature Analysis on Epitope and Receptor Binding Sites of Influenza A H1N1 Hemagglutinin |
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| WANG Shuning,Li Guoqing,WU Di,CAO Zhiwei.Mutation Feature Analysis on Epitope and Receptor Binding Sites of Influenza A H1N1 Hemagglutinin[J].Acta Biophysica Sinica,2012(6):486-498. |
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| Authors: | WANG Shuning Li Guoqing WU Di CAO Zhiwei |
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| Institution: | 1,2 1.State Key Laboratory of Bioreactor Engineering,East China University of Science & Technology,Shanghai 200237,China; 2.Shanghai Center for Bioinformation Technology,Shanghai 200235,China |
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