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| 基因组中开阅读框架长度的分布模型与基因组进化 | |
| 引用本文： | 冯立芹,李宏.基因组中开阅读框架长度的分布模型与基因组进化[J].生物物理学报,2004,20(5):375-381. |
| 作者姓名： | 冯立芹 李宏 |
| 作者单位： | 1. 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021;内蒙古民族大学物理系,通辽,028043 2. 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(10147204)，内蒙古自然科学基金项目 |
| 摘 要： | 分析了5种真核、15种细菌和10种古菌基因组中开阅读框架(open reading flame，ORF)的数目随长度的分布，发现不同生物的分布相似且有明显的规律性。用各种分布模型进行拟合比较，结果显示每种生物的这类分布均符合Г（α，β）分布，由此提出生物基因组中ORF的数目随长度的分布是Г（α，β）分布的假设。分析各生物基因组的拟合参数，发现α和β值与基因组进化存在明显的相关性；讨论了α和β值的生物进化意义，并给出了真核生物偏好使用长基因的结论；依照Г（α，β）分布估计了酵母基因组中ORF数目的上限为5870个。该方法对于研究生物基因组进化以及评估理论预测基因的可靠性具有建设性意义。 |
| 关 键 词： | 基因组 ORF Г（α，β）分布 基因组进化 |
| 收稿时间： | 2004-03-16 |
| 修稿时间： | 2004年3月16日 |
The model for the length distribution of protein coding sequences in different genomes and the genome evolution |
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| FENG Li-qin,LI Hong.The model for the length distribution of protein coding sequences in different genomes and the genome evolution[J].Acta Biophysica Sinica,2004,20(5):375-381. | |
| Authors: | FENG Li-qin LI Hong |
| Institution: | 1. Department of Physics, College of Sciences and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot, 010021, China| 2.Department of Physics, College of Sciences and Technology, Inner Mongolia University of Nationality, Tongliao 028043, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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