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部分力偏倚蒙特卡罗方法和它在计算相对自由能中的应用
引用本文:倪向善,陈润生,石秀凡.部分力偏倚蒙特卡罗方法和它在计算相对自由能中的应用[J].生物物理学报,1993,9(2):309-313.
作者姓名:倪向善  陈润生  石秀凡
作者单位:中国科学院生物物理研究所,中国科学院生物物理研究所,中国科学院昆明动物研究所 北京100101,北京100101
摘    要:提出了一种部分力偏倚蒙特卡罗模拟方法,其中力偏倚仅用于体系中每个分子质心的平动而不用于分子的转动.此方法的总体效益较之先前几种方案为佳,同时报导了该方法在自由能微扰计算中的具体应用.

关 键 词:蒙特卡罗模拟  部分力偏倚  自由能

A PARTIAL FORCE BIAS MONTE CARLO SCHEME AND ITS APPLICATION IN CALCULATING RELATIVE FREE ENERGY
Ni Xiangshan Shi Xiufan Chen Runsheng.A PARTIAL FORCE BIAS MONTE CARLO SCHEME AND ITS APPLICATION IN CALCULATING RELATIVE FREE ENERGY[J].Acta Biophysica Sinica,1993,9(2):309-313.
Authors:Ni Xiangshan Shi Xiufan Chen Runsheng
Abstract:A partial force bias scheme is proposed for the Monte Carlo simulation in which the transtation of each molecule's mass center is biased in the direction of force on it , but no bias for rotations. The total efficiency is better than previous schemes. Its application to a calculation of free energy is reported.
Keywords:Partial force bias scheme Monte carlo simulation Free energy perturbation
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