痢疾志贺氏菌亚群的比较基因组学研究与进化分析 |
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引用本文: | 宾文,杨娥,彭俊平,张笑冰,王璟,杨剑,董杰,楚雍烈,张景海,金奇.痢疾志贺氏菌亚群的比较基因组学研究与进化分析[J].中国科学C辑,2005(2). |
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作者姓名: | 宾文 杨娥 彭俊平 张笑冰 王璟 杨剑 董杰 楚雍烈 张景海 金奇 |
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作者单位: | 沈阳药科大学制药工程学院 沈阳110016病毒基因工程国家重点实验室北京100176
(宾文),西安交通大学医学院 西安710061病毒基因工程国家重点实验室北京100176
(杨娥),病毒基因工程国家重点实验室 北京100176
(彭俊平,张笑冰,王璟,杨剑,董杰),西安交通大学医学院 西安710061
(楚雍烈),沈阳药科大学制药工程学院 沈阳110016
(张景海),病毒基因工程国家重点实验室 北京100176(金奇) |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展规划项目(批准号:G1999054105),国家高技术研究发展计划项目(批准号:2001AA223011),国际科技合作重点项目(批准号:2001AA223116)资助 |
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摘 要: | 利用大肠杆菌K12MG1655株全基因组ORFs和痢疾志贺氏菌A1型Sd51197株特异性ORFs探针制备的芯片,研究了痢疾志贺氏菌13个血清型代表株的基因组组成.结果显示,该血清群成员的基因组中包含有2654个保守的源于大肠杆菌ORFs;共同缺失了219个涉及前噬菌体基因、分子伴侣、特异性O抗原合成等大肠杆菌原有的基因;并通过水平转移获得了一些特异性基因,如Ⅱ型分泌系统相关组分、铁转运相关因子等.根据基因组组成所作的进化树,发现A1,A2,A8和A10这四型菌与其他痢疾志贺氏菌亲源关系较远.研究所得结果为进一步深入探索痢疾志贺氏菌的生理过程、致病性和进化奠定了基础.
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关 键 词: | 痢疾志贺氏菌亚群 DNA芯片 比较基因组学 |
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