小麦低分子量谷蛋白亚基基因5′侧翼保守序列染色体组特异性DNA变异的分析及验证 |
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引用本文: | 龙海,魏育明,颜泽洪,Bernard Baum,Eviatar Nevo,郑有良.小麦低分子量谷蛋白亚基基因5′侧翼保守序列染色体组特异性DNA变异的分析及验证[J].中国科学C辑,2006,36(2):118-126. |
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作者姓名: | 龙海 魏育明 颜泽洪 Bernard Baum Eviatar Nevo 郑有良 |
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作者单位: | 1. 四川农业大学小麦研究所,雅安,625014 2. 四川农业大学小麦研究所,雅安,625014;四川农业大学西南作物基因资源与遗传改良教育部重点实验室,雅安,625014 3. Eastern Cereal and Oilseed Research Centre, Agriculture & Agri-Food Canada,Ottawa, K1A 0C6, Canada 4. Institute of Evolution, University of Haifa, Mt. Carmel, Haifa 31905, Israel |
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基金项目: | 国家高技术研究发展计划项目(批准号:2003AA207100),国家自然科学基金项目(批准号:30300219,30571163),高等学校优秀博士学位论文作者专项资金项目(批准号:200357,200458),长江学者和创新团队发展计划项目(IRT0453)资助 |
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摘 要: | 根据33个低分子量麦谷蛋白亚基(LMW-GS)基因5′侧翼序列的相似性进行聚类分析, 可将其划分成8个类群, 这与基于N末端推导氨基酸序列进行的类群划分结果完全一致. 序列比对发现, 各类群基因5′侧翼保守序列间存在DNA多态性, 共发现34个多态性位点, 其中18个为潜在单核苷酸多态性位点(SNPs, single nucleotide polymorphisms). 除1个LMW-GS类群之外, 其余7个类群的5′侧翼序列均具有类群特异性DNA变异位点. 根据类群间的DNA多态性对这7个类群设计了特异引物, 利用普通小麦(Triticum aestivum L.)品种中国春及其第1同源群双端体系对其进行染色体定位分析, 揭示了1AS, 1BS和1DS上分别有第2, 1和4类群. 对PCR产物的克隆测序进一步验证了不同染色体组上的LMW-GS基因类群间5′侧翼序列具有特异性. 这些结果表明, LMW-GS基因的编码区及其5′侧翼保守序列可能是协调进化的. 本文报道的7对引物可对7类LMW-GS基因的完整编码区进行特异扩增, 因而能在小麦复杂的遗传背景下有目的地对某一类LMW-GS基因进行分离克隆, 这有助于弄清单个LMW-GS对小麦品质的贡献. 同时, 在小麦育种中, 这些标记对于有效地选择与品质密切相关的LMW-GS组分有一定应用价值.
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关 键 词: | LMW-GS基因 5′侧翼序列 DNA多态性 SNP 基因克隆 小麦 |
收稿时间: | 2005-10-24 |
修稿时间: | 2005年10月24 |
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