| 肠道病毒71型中国分离株全基因组核苷酸序列分析 |
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| 引用本文： | 杨帆,金奇,何雅青,李良成,侯云德.肠道病毒71型中国分离株全基因组核苷酸序列分析[J].中国科学C辑,2001,31(2):163-167. |
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| 作者姓名： | 杨帆 金奇 何雅青 李良成 侯云德 |
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| 作者单位： | (1)病毒基因工程国家重点实验室 ,北京 100052 ,中国 |
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| 摘 要： | 对肠道病毒71型(enterovirus71,EV71)中国(深圳)分离株SHZH98基因组建立了覆盖全基因组的5个首尾重叠的克隆,并在此基础上进行了全基因组(未包括多聚腺苷酸尾)7408个碱基的核苷酸序列测定.数据分析表明,SHZH98株与其他EV71毒株相比,5′UTR和3′UTR的长度和序列有一定的差异.同源性分析发现,与免疫源性密切相关的P1结构蛋白基因与台湾流行株的同源性最高,与欧美流行株的同源性较低,P2,P3区非结构蛋白基因的同源性与Coxsakievirus A16及MS,BrCr株较高,而与台湾流行株相比则较低.遗传进化分析发现,SHZH98株结构蛋白基因与台湾流行株亲缘关系较近,而非结构蛋白基因与Coxsakievirus A16及MS,BrCr株的亲缘关系较近.上述结果在分子水平上对肠道病毒71型中国分离株进行分析,并探索了中国分离株的可能进化途径,有助于肠道病毒71型及整个肠道病毒的基础研究和我国对于EV71所致疾病的预防.
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| 关 键 词： | 核苷酸序列分析 同源性分析 肠道病毒71型 |
| 收稿时间： | 2000-04-28 |
| 修稿时间： | 2000-09-29 |
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