基于S6K1基因部分序列的鲤科鱼类系统发育关系及内含子1 Indel位点分析 |
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引用本文: | 孔祥会,王绪祯,甘小妮,李俊兵,何舜平.基于S6K1基因部分序列的鲤科鱼类系统发育关系及内含子1 Indel位点分析[J].中国科学C辑,2007,37(4):427-434. |
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作者姓名: | 孔祥会 王绪祯 甘小妮 李俊兵 何舜平 |
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作者单位: | 1. 中国科学院水生生物研究所,武汉,430072;河南师范大学生命科学学院,新乡,453007 2. 中国科学院水生生物研究所,武汉,430072 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划);国家自然科学基金;中国博士后科学基金 |
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摘 要: | 鲤科鱼类在东亚分布广泛且数量丰富, 在物种演化上具有重要的系统发育地位. 本研究基于S6K1基因5′端功能调控序列, 通过PCR扩增、克隆和测序, 共获得30种鱼类S6K1 前端部分DNA序列(外显子1, 外显子2及内含子1), 对序列变异进行分析, 并采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)重建鲤科鱼类系统发育关系. 亚口鱼科的胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)作为外类群, 通过4种方法所得系统发育分支图大致相同, 均以较高的节点支持率支持雅罗鱼系和鲃系的划分, 雅罗鱼系包括雅罗鱼亚科东亚类群(East Asian group in Leuciscinae)、鲢亚科(Hypophthalmichthyinae)、鲴亚科(Xenocyprinae)、鲌亚科(Cultrinae)、
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关 键 词: | S6K1基因 系统发育 内含子 鲤科(Cyprinidae) |
收稿时间: | 2007-01-24 |
修稿时间: | 2007年1月24日 |
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