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含Ds转座因子的T-DNA在水稻染色体上的分布研究
引用本文:王江,李琳,宛新杉,安林升,张景六.含Ds转座因子的T-DNA在水稻染色体上的分布研究[J].中国科学C辑,2004,34(1):14-22.
作者姓名:王江  李琳  宛新杉  安林升  张景六
作者单位:中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032
基金项目:国家重点基础研究发展规划资助项目(批准号:G1999011601)
摘    要:应用农杆菌介导的方法获得了有Ds因子插入的3000多株水稻转化群体, 用Inverse PCR方法, 从部分独立转化植株中分离了590条含Ds因子的T-DNA插入位点处的右侧旁邻水稻染色体序列. 根据旁邻序列中T-DNA右边界与侧翼水稻序列之间的插入序列的特征可分成6个主要类别, 其中类型Ⅰ是主要类型, 为通常的T-DNA整合, 即T-DNA右边界序列与水稻染色体序列相连, 或者其间插入小于50 bp的序列片段; 类型Ⅱ为T-DNA右边界旁先接T-DNA载体序列, 再与水稻序列相接的重组类型. 340个类型Ⅰ和Ⅱ的旁邻序列通过与已知的水稻染色体序列数据库一致性比较分析, 确定了它们在水稻染色体上的分布位置, 构建了一个Ds因子在水稻12条染色体插入的框架结构. 这340个有Ds因子插入的位点在整个染色体上平均相距0.8 Mb. 分析在第1条染色体上T-DNA(Ds)插入情况显示有21%的频率插入到预测基因的外显子中. T-DNA(Ds)在染色体上分布位置的确定, 使我们可以选择合适的Ds因子插入株作为起始株系, 导入Ac转座酶基因后, 使Ds发生转座, 从而获得新的Ds插入突变株, 为进一步利用Ds转座标签法分离水稻基因创造了条件.

关 键 词:T-DNA  突变遗传学  水稻  Ds转座因子
收稿时间:2003-07-04
修稿时间:2003年7月4日
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