| 志贺氏菌属鲍氏(S. boydii)亚群基因组组成与进化分析 |
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| 引用本文： | 张笑冰,王璟,彭俊平,杨娥,宾文,杨剑,董杰,孙立连,徐星晔,金奇.志贺氏菌属鲍氏(S. boydii)亚群基因组组成与进化分析[J].中国科学C辑,2005,35(4):359-364. |
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| 作者姓名： | 张笑冰 王璟 彭俊平 杨娥 宾文 杨剑 董杰 孙立连 徐星晔 金奇 |
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| 作者单位： | 病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176 |
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| 基金项目： | 国家重大基础研究规划项目(批准号: G1999054103)、国家高技术研究发展计划项目(批准号: 2001AA223011)及国际科技合作重点项目(批准号: 2001AA223116)资助 |
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| 摘 要： | 利用比较基因组杂交法(comparative genomic hybridization, CGH)对志贺氏菌属鲍氏(S. boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析, 结果显示, 该亚群基因组的“共有骨架”包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs. 比对K12基因组, 该亚群所有菌株基因组共同缺失ORFs为199个, 主要涉及外膜蛋白编码基因和O-抗原合成相关基因, 而属于亚群特异性的ORFs主要以噬菌体基因和未知功能ORFs为主, 一些参与铁离子代 谢、运输和Ⅱ型分泌系统基因在大多数的鲍氏菌株中存在. 以比较基因组杂交法得到的进化分析显示: 鲍氏亚群18个血清型代表菌株可分为4组, 其中13型与其他菌株有较大的差异. 这种分组结果与某些代谢相关的基因分布情况存在对应关系. 通过对该亚群“共有骨架”、缺失基因和株特异基因, 以及进化分类等方面的分析, 以期探索该亚群基因组的进化规律, 并为志贺氏菌属鲍氏亚群的致病机理、疫苗研制和药物开发等方面的研究提供重要线索.
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| 关 键 词： | 比较基因组杂交 株特异性ORFs 进化 志贺菌属鲍氏亚群 |
| 收稿时间： | 2004-12-23 |
| 修稿时间： | 2005年4月18日 |
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