花鲈(Lateolabrax japonicus)VAMP-2基因的特征研究 |
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引用本文: | 陈魁,黄晓航,包振民,Gaisano Herbert.花鲈(Lateolabrax japonicus)VAMP-2基因的特征研究[J].中国科学C辑,2006,36(4):334-339. |
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作者姓名: | 陈魁 黄晓航 包振民 Gaisano Herbert |
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作者单位: | 1. 中国海洋大学海洋生命学院,青岛,266003;国家海洋局第一海洋研究所,青岛,266061 2. 国家海洋局第一海洋研究所,青岛,266061 3. 中国海洋大学海洋生命学院,青岛,266003 4. Department of Medicine and Physiology,University of Toronto,Toronto,M5S1A8,Canada |
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基金项目: | 国家自然科学基金;国家高技术研究发展计划(863计划) |
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摘 要: | 应用反转录PCR和锚定PCR方法克隆了全长715个碱基的花鲈(Lateolabrax japonicus)SPV2基因, 证明其编码110个氨基酸的VAMP-2蛋白. 运用生物信息学研究工具进行的一级结构分析显示: SPV2蛋白含有SNARE基序及其核心精氨酸残基, 其序列N端有一N-糖肽键的糖基化位点, C端有一跨膜结构域. 高级结构预测揭示SPV2蛋白的主要空间构象是一个组成SNARE基序的α螺旋卷曲骨架, 其主要细节都与X晶体衍射方法得到的大鼠VAMP-2结构相一致. 半定量PCR结果表明: 在mRNA水平上, VAMP-2基因在鱼体各组织中广泛表达, 其中以脑组织最为突出, 而肌肉组织则相对最少.
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关 键 词: | VAMP-2蛋白 SNARE蛋白 生物信息学分析 花鲈 |
收稿时间: | 2005-07-14 |
修稿时间: | 2005年7月14日 |
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