志贺菌福氏2a毒力大质粒DNA全序列的测定与基因分析 |
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引用本文: | 张继瑜,刘红,张笑兵,杨剑,杨帆,杨国威,沈岩,侯云德,金奇.志贺菌福氏2a毒力大质粒DNA全序列的测定与基因分析[J].中国科学C辑,2003,33(1):40-46. |
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作者姓名: | 张继瑜 刘红 张笑兵 杨剑 杨帆 杨国威 沈岩 侯云德 金奇 |
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作者单位: | 1. 病毒基因工程国家重点实验室,北京,100052;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州,730050 2. 病毒基因工程国家重点实验室,北京,100052 3. 国家人类基因组北方研究中心,北京,100767 |
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基金项目: | 国家重大基础研究计划(批准号:G1999054105),高技术研究计划(批准号:Z19-05-01)资助项目 |
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摘 要: | 对志贺菌福氏2a 301株的毒力大质粒pCP301的DNA全序列进行了测定, 并进行了结构分析. 结果表明, pCP301 DNA全序列由221618个碱基对组成, 基因分析共确定了272个开放读码框架(ORF), 经过与基因数据库比较, 其中194个ORF与已知基因或编码产物具有高同源性, 61个ORF同源性较低, 其余17个为新确定的未知功能的ORF. pCP301中的基因主要包括: (ⅰ) 与细菌毒力有关的ipa-mxi-spa, osp和iph基因; (ⅱ) 与调控有关的vir基因; (ⅲ) 与质粒的维持、稳定和DNA代谢有关的mvp, stb, rep和par等基因; (ⅳ) 转座酶编码基因. pCP301中的插入序列总长68 kb, 占全序列的 30%, 提示pCP301在细菌生长与进化过程中发生了多次基因重排. 研究结果对揭示志贺菌的致病机理及大质粒的遗传与进化有重要意义.
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关 键 词: | 毒力大质粒 pCP301 DNA 测定 分析 志贺菌福氏2a |
收稿时间: | 2002-04-03 |
修稿时间: | 2002年4月3日 |
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