人健康肝组织刀豆凝集素(Con A)结合型糖蛋白组学研究 |
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引用本文: | 孙强玲,刘银坤,卢雯静,程钢,周海君,周信文,魏黎明,代智,郭坤,陆皓杰.人健康肝组织刀豆凝集素(Con A)结合型糖蛋白组学研究[J].中国科学C辑,2006,36(6):543-551. |
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作者姓名: | 孙强玲 刘银坤 卢雯静 程钢 周海君 周信文 魏黎明 代智 郭坤 陆皓杰 |
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作者单位: | 1. 复旦大学附属中山医院肝癌研究所,教育部"癌变和侵袭原理"重点实验室,上海,200032 2. 复旦大学生物医学研究院生物信息学中心,上海,200433 3. 复旦大学生物医学研究院蛋白质组学研究中心,上海,20043 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划) |
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摘 要: | 通过凝集素亲和层析技术结合双向电泳-质谱技术构建人健康肝组织Con A结合型糖蛋白数据库并进行生物信息学分析; 利用研磨和匀浆两步法抽提人健康肝组织总蛋白, 通过固相凝集素亲和层析获得与刀豆凝集素(Con A)结合型糖蛋白, 经过双向电泳、荧光染色、图像分析获得人健康肝组织表达谱; 通过MALDI-TOF-MS质谱鉴定及生物信息学分析获得人健康肝组织数据库, 并建立了高重复性的人健康肝组织Con A结合型糖蛋白表达谱, 图谱均点数为301±15, 挖取139个蛋白点进行质谱鉴定, 去冗余后确定了85个与细胞周期、代谢通路相关的蛋白质; 通 过NetNGlyc和NetOGlyc对糖基化位点进行预测, 并按照geneontology对其功能定位等进行分类, 并对其中与肿瘤发生发展相关的蛋白进行具体分析. 由此可见, 凝集素亲和层析结合2-DE, 质谱鉴定是一种高通量的检测方法, Con A结合型糖基化修饰谱的构建为后续研究奠定了基础.
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关 键 词: | A) 亲和层析 糖蛋白组学 人健康肝组织 刀豆凝集素(Con |
收稿时间: | 2006-05-08 |
修稿时间: | 2006年5月8日 |
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