基于细胞色素b基因片段序列研究中国近海石斑鱼类系统进化关系 |
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引用本文: | 庄轩,丁少雄,郭丰,王军,苏永全,张其永,李祺福.基于细胞色素b基因片段序列研究中国近海石斑鱼类系统进化关系[J].中国科学C辑,2006,36(1):27-34. |
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作者姓名: | 庄轩 丁少雄 郭丰 王军 苏永全 张其永 李祺福 |
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作者单位: | 1. 厦门大学海洋学系,亚热带海洋研究所,厦门,361005 2. 厦门大学海洋学系,亚热带海洋研究所,厦门,361005;厦门大学生物学系,厦门,361005 3. 厦门大学生物学系,厦门,361005 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(批准号:40306023),福建省重大科技项目(批准号:2002N009),中国高新技术研究计划(批准号:2001AA621010)资助 |
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摘 要: | 石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学中的一个难题. 为探讨中国近海石斑鱼类系统进化关系, 通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属28个种类的线粒体细胞色素b基因片段序列. 采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析, 计算了Kimura 2-parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数, 并结合GenBank上石斑鱼属的同源序列, 以东洋鲈(Niphon spinosus)、真鲷(Pagrus major)等为外群构建NJ, MP, ML和ME系统树. 从分子系统学的角度并结合形态学特征得出了如下结果: (i) 鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化, 是石斑鱼亚科中原始的类群; (ii) 侧牙鲈属(Variola)与九棘鲈属(Cephalopholis)具有较近的亲缘关系; (iii) 九棘鲈属是一个单系群, 并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始; (iv) 宽额鲈(Promicrops lanceolatus)和驼背鲈(Cromileptes altivelis)可以归入石斑鱼属; (v) 石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支.
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关 键 词: | 分子系统学 细胞色素b基因 线粒体DNA 石斑鱼亚科 |
收稿时间: | 2005-04-25 |
修稿时间: | 2005年5月29日 |
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