萱草叶片响应低温胁迫的转录组分析 |
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引用本文: | 黄东梅,陈颖,白露,倪迪安,徐奕扬,张志国,秦巧平.萱草叶片响应低温胁迫的转录组分析[J].植物研究,2022,42(3):424-436. |
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作者姓名: | 黄东梅 陈颖 白露 倪迪安 徐奕扬 张志国 秦巧平 |
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作者单位: | 上海应用技术大学生态技术与工程学院,上海 201418 |
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基金项目: | 上海市农委科技兴农重点项目(2019-02-08-00-08-F01107) |
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摘 要: | 低温胁迫是萱草(Hemerocallis fulva)生长过程中经常会遭遇的一种非生物胁迫。比较了萱草叶片在低温处理(10、5、0 ℃)下转录组与对照(15 ℃)数据的差异,共筛选出差异表达基因2 457个,其中上调基因1 253个,下调基因1 204个。差异表达基因主要富集在细胞过程、代谢过程和催化活性等49个GO过程,代谢途径、次生代谢产物的生物合成、植物激素信号转导等42条KEGG代谢途径中。其中参与植物激素信号转导通路的差异表达基因发生了不同程度的变化,GH3.10基因上调至对照组的13.624倍,IAA1基因下调0.120倍;参与可溶性糖合成通路的差异基因发生了0.076~28.114倍不同程度的变化。随后对3个低温处理组共有的29个差异表达基因进行热图和网络调控分析,基于基因在网络调控中的位置,对ABCF5、OFPs和SWEETs等基因在冷应答的作用进行了分析。本研究结果为进一步挖掘萱草低温响应的关键基因及耐寒萱草种质开发、分子育种提供了一定的理论支撑。
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关 键 词: | 萱草 低温胁迫 转录组 激素 可溶性糖 |
收稿时间: | 2020-12-18 |
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