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基于线粒体ND4基因和核c-mos基因初步探讨广西拟水龟和艾氏拟水龟的系统发生
引用本文:胡启平,黄程新,许淑茹,张秋明,马宁,钟汉明.基于线粒体ND4基因和核c-mos基因初步探讨广西拟水龟和艾氏拟水龟的系统发生[J].四川动物,2013,32(2):180-186.
作者姓名:胡启平  黄程新  许淑茹  张秋明  马宁  钟汉明
作者单位:1. 广西医科大学细胞生物学与遗传学教研室,南宁,530021
2. 漳州卫生职业学院,福建漳州,363000
3. 广西水产技术推广总站,南宁,530022
4. 广西水产研究所,南宁,530021
5. 钦州市龟鳖协会,广西钦州,535000
基金项目:水产畜牧业广西地方标准制定项目计划
摘    要:广西拟水龟和艾氏拟水龟的分类和系统发生多年来存在争议。通过测定广西拟水龟、艾氏拟水龟和黄喉拟水龟线粒体ND4基因和核c-mos基因部分序列,合并GenBank中拟水龟属其他物种的ND4基因和c-mos基因部分序列进行分析,从分子水平探讨广西拟水龟和艾氏拟水龟的系统发生。ND4基因数据分析发现NJ、MP和BI树中广西拟水龟与安南拟水龟的聚类分支相互交织聚为一支,二者种内遗传距离均为0.002~0.017,种间遗传距离为0.000~0.035,种间遗传距离明显小于同属内其他种间0.056~0.109的遗传距离,表明广西拟水龟与安南拟水龟可能为同一物种,可能是安南拟水龟的同种异名,或是作为安南拟水龟的一个亚种;NJ树、MP树和BI树均显示,艾氏拟水龟与黄喉拟水龟的位置和关系最为相近,二者间的遗传距离为0.020~0.035,明显小于拟水龟属其他物种间遗传距离,而明显大于同属各物种内遗传距离,艾氏拟水龟与黄喉拟水龟之间系统分类关系是介于种内与种间之间;乌龟、中华花龟、安南拟水龟等物种都是与拟水龟属中其他物种先聚成一支后再与同科的地龟属的地龟形成姐妹支,支持将乌龟属、花龟属和安南龟属并入拟水龟属的分类。c-mos基因数据分析发现,拟水龟属各物种间不存在明显的遗传距离,NJ树和MP树也未能对属中各物种的分子系统发生位置进行有效的界定,但在属及属以上阶元的分子分类系统中c-mos基因可以作为分类依据,并与线粒体基因数据有较好的一致性。

关 键 词:ND4基因  c-mos基因  广西拟水龟  艾氏拟水龟  系统发生

Primary Phylogenies of Mauremys guangxiensis and Mauremys iversoni Inferred from DNA Sequences of Mitochondrial ND4 Gene and Nuclear c-mos Gene
HU Qiping , HUANG Chengxin , XU Shuru , ZHANG Qiuming , MA Ning , ZHONG Hanming.Primary Phylogenies of Mauremys guangxiensis and Mauremys iversoni Inferred from DNA Sequences of Mitochondrial ND4 Gene and Nuclear c-mos Gene[J].Sichuan Journal of Zoology,2013,32(2):180-186.
Authors:HU Qiping  HUANG Chengxin  XU Shuru  ZHANG Qiuming  MA Ning  ZHONG Hanming
Abstract:
Keywords:
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