蜜环菌糖苷水解酶家族基因在菌索与菌丝间的差异表达分析 |
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引用本文: | 李兵,刘柳,单婷婷,郭顺星.蜜环菌糖苷水解酶家族基因在菌索与菌丝间的差异表达分析[J].菌物学报,2021,40(6):1369-1379. |
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作者姓名: | 李兵 刘柳 单婷婷 郭顺星 |
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作者单位: | 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 北京 100193 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81773843);国家自然科学基金(81803666);中国医学科学院医学与健康科技创新工程(CIFMS);中国医学科学院医学与健康科技创新工程(2017-I2M-3-013) |
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摘 要: | 蜜环菌是一种兼性腐生和寄生的真菌,通过降解伴栽基质并为药用植物(天麻)或菌物(猪苓)提供营养物质,而糖苷水解酶是这一过程的主要酶类。本研究从蜜环菌Armillaria mellea541菌株转录数据库中共获得糖苷水解酶家族基因170个,分布于39个亚家族。进一步分析发现,这些家族基因编码的糖苷水解酶家族蛋白(glycoside hydrolase family,GHF)结构域多达48种181个,以Aamy、Glyco_hydro、Melibiase_C、NodB homology和PA14等结构域为主。对糖苷水解酶家族蛋白进行了系统的Gene Ontology (GO)功能注释和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)代谢通路分析,其功能以结合、水解和催化细胞壁成分为主。编码GHF3(A0A2H3D3T6)、GHF78(A0A2H3D8T6)、GHF51(A0A2H3E4X4)、GHF47(A0A2H3EK71)和GHF5(A0A2H3EBW7)等5个糖苷水解酶家族蛋白的基因在A. mellea541菌索与菌丝间差异表达,其结构域依次为PA14、Bac_rhamnosid6H/C、Alpha-L-AF_C、Glyco_hydro_47和Glyco_hydro_5,可能发挥结合碳水化合物和催化鼠李糖苷、阿拉伯呋喃糖苷、甘露糖残基和纤维素等水解的功能,这为研究蜜环菌与天麻或猪苓的相互作用提供了理论依据。
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关 键 词: | 蜜环菌 菌索 糖苷水解酶家族 糖苷水解酶结构域 |
收稿时间: | 2021-02-28 |
Analyses of the glycoside hydrolase family genes and their differential expressions between rhizomorphs and hypha in Armillaria mellea |
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Authors: | LI Bing LIU Liu SHAN Ting-Ting GUO Shun-Xing |
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Institution: | Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences, Peking Union Medical College, Beijing 100193, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | Armillaria mellea rhizomorphs glycoside hydrolase family glycoside hydrolase domain |
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