草菇低温胁迫初期应答关键通路的探究 |
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引用本文: | 吕贝贝,吴潇,莫芹,孙宇,蒋玮,黄艳娜,武国干,宋丽莉,王金斌,李鹏,刘刚,唐雪明.草菇低温胁迫初期应答关键通路的探究[J].菌物学报,2021,40(5):1074-1086. |
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作者姓名: | 吕贝贝 吴潇 莫芹 孙宇 蒋玮 黄艳娜 武国干 宋丽莉 王金斌 李鹏 刘刚 唐雪明 |
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作者单位: | 1.上海市农业科学院生物技术研究所 上海 2011062.上海市农业遗传育种重点实验室 上海 201106 |
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基金项目: | 上海市科委一带一路项目(20310750500);上海市科委社会发展科技领域重点项目(19DZ1203802);国家自然科学基金(31801511);上海市农业科学院科技支撑项目(KJZC202008);上海市农业科学院卓越团队(2017 B-07) |
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摘 要: | 本研究利用表达谱芯片技术解析了低温胁迫初期(0-120min)不同低温处理时间草菇转录组水平的变化。芯片结果分析发现在低温诱导过程中,低温处理20min内变化基因的功能为单加氧酶、氧化还原酶和细胞内的氧化还原。低温处理40min时表达差异基因具有结合RNA的功能。80min的时间段内,基因的功能比较集中于核酸物质和能量的代谢。CYP450的代谢途径在20-40min、60-80min和100-120min低温处理的菌丝体中均有显著性变化,表明这一通路在草菇低温处理过程中表现活跃。基因表达趋势分析发现34个表达差异基因富集到显著表达趋势模型,基因共表达网络分析发现VVO_04066位于网络的核心地位,推测VVO_04066通过提高磷酸肌醇特异性磷脂酶C(PI-PLC)的胞内水平,促进糖蛋白和几丁质的合成,从而完成草菇细胞的低温胁迫应答。
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关 键 词: | 草菇 表达谱芯片 耐低温 CYP450 VVO_04066 |
收稿时间: | 2020-09-07 |
Investigation of the key potential pathway involved in the early response to low temperature challenge in Volvariella volvacea |
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Authors: | LV Bei-Bei WU Xiao MO Qin SUN Yu JIANG Wei HUANG Yan-Na WU Guo-Gan SONG Li-Li WANG Jin-Bin LI Peng LIU Gang TANG Xue-Ming |
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Institution: | 1. Biotechnology Research Institute, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201106, China2. Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding, Shanghai 201106, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | Volvariella volvacea cDNA microarray low temperature resistance CYP450 VVO_04066 |
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