| 金针菇单、双核菌丝差异表达基因分析 |
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| 引用本文： | 王威,丑天胜,刘芳,严俊杰,吴塔菊,李少杰,谢宝贵. 金针菇单、双核菌丝差异表达基因分析[J]. 菌物学报, 2015, 34(4): 683-693. DOI: 10.13346/j.mycosystema.150054 |
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| 作者姓名： | 王威 丑天胜 刘芳 严俊杰 吴塔菊 李少杰 谢宝贵 |
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| 作者单位： | 1福建农林大学生命科学学院菌物研究中心 福建 福州 3500022中国科学院微生物研究所 北京 100101 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划（973项目）（2014CB138302）;国家现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS24） |
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| 摘 要： | 对金针菇Flammulina velutipes单核菌丝W23的菌丝体以及与L11质配后的双核菌丝H1123菌丝体进行了转录组测序,以本实验室已获得的W23基因组为参考基因组研究两样本间差异基因,并对这些差异基因进行了GO功能和Pathway显著性富集分析。差异基因分析显示,两个样本中共有显著性差异表达的基因3 504个,其中在双核菌丝中上调、下调的基因数分别为2 151和1 353个。研究发现差异表达基因含有很多的转录因子基因、蛋白激酶以及WD40 repeat-like蛋白。Gene Ontology（GO）功能分析结果表明,extracellular region和membrane-enclosed lumen条目下的差异基因全部为上调表达,而envelope下的差异基因全部为下调表达,以利于双核菌丝分裂时锁状联合的形成而便于核的迁移。Pathway 功能富集分析结果表明,脂肪酸、氨基酸以及大部分糖类合成相关基因具有比较活跃的上调表达。说明双核菌丝主要进行营养物质的富集,为下一步在合适条件下分化成原基,进入生殖生长阶段储备物质基础。
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| 关 键 词： | 转录组 差异表达基因 GO功能 Pathway分析 |
| 收稿时间： | 2015-02-22 |
Comparison of gene expression patterns between the monokaryotic and dikaryotic mycelia of Flammulina velutipes |
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| Wei WANG,Tian-Sheng CHOU,Fang LIU,Jun-Jie YAN,Ta-Ju WU,Shao-Jie LI,Bao-Gui XIE. Comparison of gene expression patterns between the monokaryotic and dikaryotic mycelia of Flammulina velutipes[J]. Mycosystema, 2015, 34(4): 683-693. DOI: 10.13346/j.mycosystema.150054 |
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| Authors: | Wei WANG Tian-Sheng CHOU Fang LIU Jun-Jie YAN Ta-Ju WU Shao-Jie LI Bao-Gui XIE |
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| Affiliation: | 1Mycological Research Center, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China2 Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China |
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| Abstract: | |
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