| 草菇基因组中11个漆酶同源基因的生物信息学分析及铜离子对其表达的影响 |
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| 引用本文： | 吴林,朱刚,陈明杰,汪虹,鲍大鹏.草菇基因组中11个漆酶同源基因的生物信息学分析及铜离子对其表达的影响[J].菌物学报,2014,33(2):323-333. |
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| 作者姓名： | 吴林 朱刚 陈明杰 汪虹 鲍大鹏 |
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| 作者单位： | 国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海 201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海 201403 上海海洋大学食品科学与工程学院 上海 201306;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海 201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海 201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海 201403 |
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| 基金项目： | 上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字（2011）第1-2号]；上海市农业科学院科技发展基金[农科发2013（02）] |
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| 摘 要： | 通过分析草菇基因组中11个漆酶同源基因所编码的蛋白的性质、转录调控元件和测定铜离子存在条件下的草菇漆酶活性及11个漆酶基因的转录水平,揭示了草菇漆酶基因的各自特性、差异以及基因功能与进化机制。分析表明,这11个漆酶同源基因编码的蛋白具有508–562aa个氨基酸,分子量和理论等电点分别为56.25–60.75kDa和4.51–6.18(未经翻译后修饰),且都具有真菌漆酶铜离子结合区域的特征序列、4个能够结合催化底物的环形结构以及信号肽序列,都属于分泌性的胞外蛋白,但其底物结合位点数目、loop序列的一致性、跨膜区域数目和位置以及信号肽位置等存在较大差异。草菇11个漆酶起始密码子上游2 000bp的序列中含有真核生物的基本转录调控元件(TATA‐box,CAAT‐box及GC‐box)和多个潜在的调控元件(MRE、XRE、STRE、HSE、ARE、TRE、NIT元件等),但每个基因所含调控元件数目及种类各有不同。在液体培养条件下,铜离子能够诱导除vv‐lac2、vv‐lac3和vv‐lac7之外的其余8个草菇漆酶基因的表达,且适宜浓度的铜离子有助于草菇漆酶活性的增加。
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| 关 键 词： | 草菇 漆酶基因 铜离子 表达 |
The bioinformatic analyses and the gene expression induced by Cu2+ of 11 laccase homologous genes from Volvariella volvacea |
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| Authors: | WU Lin ZHU Gang CHEN Ming-Jie WANG Hong and BAO Da-Peng |
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| Institution: | National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Resources and Utilization of Edible Fungi (South), Ministry of Agriculture, China; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Resources and Utilization of Edible Fungi (South), Ministry of Agriculture, China; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China College of Food Sciences and Technology, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Resources and Utilization of Edible Fungi (South), Ministry of Agriculture, China; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Resources and Utilization of Edible Fungi (South), Ministry of Agriculture, China; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Resources and Utilization of Edible Fungi (South), Ministry of Agriculture, China; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Volvariella volvacea laccase gene copper ion expression |
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