黑茶中“金花菌”线粒体基因组序列测定及系统发育分析 |
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引用本文: | 胡治远,刘素纯,徐正刚.黑茶中“金花菌”线粒体基因组序列测定及系统发育分析[J].菌物学报,2021,40(1):135-151. |
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作者姓名: | 胡治远 刘素纯 徐正刚 |
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作者单位: | 1.湖南农业大学食品科学技术学院 湖南 长沙 4101282.湖南城市学院材料与化学工程学院 湖南 益阳 413000 |
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基金项目: | 黑茶金花湖南省重点实验室;湖南城市学院大学生创新创业训练计划 |
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摘 要: | 本研究对黑茶中优势微生物“金花菌”线粒体基因序列进行测定与生物信息分析,并探究其与近缘种微生物的系统发育关系。结果表明,“金花菌”线粒体基因组是一条全长77 649bp的环状DNA分子,其ATCG 4种碱基所占比例分别为34.14%、37.64%、15.61%、12.61%,具有显著的A-T偏向性。基因组共编码42个基因(15个蛋白质编码基因,2个rRNA基因和25个tRNA),与近缘种相比缺失了trnT-TGT且多了1个trnM-CAT拷贝,排列顺序上则较为保守。蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为Leu、Ile、Ser、Phe和Val;RSCU频率最高的4个密码子依次是UUA、AUA、UUU和AAU。25个tRNA基因均可形成典型三叶草结构,并存在有35处G-U错配。系统发育分析表明:与“金花菌”分类地位上最密切是Aspergillus pseudoglaucus。依据菌株形态学与系统发育分析的结果,本研究支持将“金花菌”归类于Aspergillus属并使用A. cristatus这一名称的分类观点。
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关 键 词: | 冠突曲霉 线粒体基因组 信息分析 系统发育 |
收稿时间: | 2020-05-14 |
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