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| 地衣型真菌的I型内含子及其在系统发育中的应用 | |
| 引用本文： | 曹叔楠,刘萌,周启明,郭守玉.地衣型真菌的I型内含子及其在系统发育中的应用[J].菌物学报,2011,30(6):920-931. |
| 作者姓名： | 曹叔楠 刘萌 周启明 郭守玉 |
| 作者单位： | 1. 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室 北京100101;中国科学院研究生院 北京100039 2. 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室 北京100101;山东农业大学生命科学学院 泰安271018 3. 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室 北京100101 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金（Nos. 30670004，30770012） |
| 摘 要： | 以蜈蚣衣属、黑蜈蚣衣属地衣样品为材料，结合GenBank中相关数据，对地衣型真菌核糖体小亚基 DNA上的I型内含子分布模式进行归纳，并探讨了其在地衣型真菌系统发育研究中的应用。结果表明在地衣型真菌核糖体小亚基 DNA上存在多个I型内含子插入位点，通过二级结构分析给出了天然状态下I型内含子发生转座的证据。分析显示，I型内含子作为分子标记，只适合用于种下单位的系统发育研究中。 |
| 关 键 词： | Ⅰ型内含子分布模式，二级结构，小亚基rDNA，ITS序列 |
Group I introns in lichen forming fungi and their application for phylogenetic analysis |
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| Authors: | CAO Shu-Nan LIU Meng ZHOU Qi-Ming and GUO Shou-Yu |
| Institution: | CAO Shu-Nan1,2 LIU Meng1,3 ZHOU Qi-Ming1* GUO Shou-Yu1* 1Key Laboratory of Systematic Mycology and Lichenology,Institute of Microbiology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101,China 2Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100039,China 3College of Life Sciences,Shandong Agriculture University,Tai'an 271018,China |
| Abstract: | Group I introns in SSU (Small Subunit) rDNA of lichen forming fungi and their distribution modes were analyzed in this study. The data were obtained from eight species of the lichen genera Physcia and Phaeophyscia with some sequences retrieved from GenBank. Our result indicates that there are multiple group I introns insertion sites in SSU rDNA of lichen forming fungi, and their secondary structures gives the evidences of transposition when group I introns are in its nature states. Our result also demonstrates that group I introns are only suitable for the phylogenetic analysis at infraspecific levels. |
| Keywords: | distribution mode of group I introns secondary structure small subunit rDNA ITS sequence |
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