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利用巴西橡胶树寡核苷酸芯片筛选死皮相关基因
引用本文:李德军,覃碧,邓治,刘向红.利用巴西橡胶树寡核苷酸芯片筛选死皮相关基因[J].植物生理学通讯,2012(9):901-908.
作者姓名:李德军  覃碧  邓治  刘向红
作者单位:[1]中国热带农业科学院橡胶研究所,农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,海南儋州571737 [2]海南大学农学院,海口570228
基金项目:海南省自然科学基金(310072)、国家自然科学基金(30960310)和中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项(1630022011024和RC201204).
摘    要:以健康和死皮巴西橡胶树品系热研7.33—97树皮为实验材料,利用定制橡胶树寡核苷酸芯片筛选橡胶树死皮相关基因。在橡胶树寡核苷酸芯片包含的566个基因中,死皮与健康树树皮差异表达倍数在2倍或2倍以上的有56个,占筛选转录本总数的9.9%。在56个死皮相关基因中,死皮树中上调表达基因有3个,下调表达基因有53个。这些死皮相关基因共涉及8个功能分类,“抗性及防御反应”所占比例最高,接下来是“蛋白质合成、加工及转运”和“代谢和能量”,以上三类功能基因占66.07%。此外,死皮相关基因还涉及“细胞结构、生长及分化”、“细胞信号转导”、“转录相关”、“橡胶生物合成”和“未知功能”。为验证芯片结果的可信性,随机选取18个基因进行RT-PCR分析,结果表明被检测基因表达模式均与芯片结果完全一致。本研究鉴定并分析了死皮相关基因,为进一步揭示橡胶树死皮发生机制奠定了基础。

关 键 词:巴西橡胶树  树皮  死皮分子机制  死皮相关基因  寡核苷酸芯片

Identifying the Genes Related to Tapping Panel Dryness by Hevea brasiliensis Oligonucleotide Microarrays
LI De-Jun,QIN Bi,DENG ZhiI,LIU Xiang-Hong.Identifying the Genes Related to Tapping Panel Dryness by Hevea brasiliensis Oligonucleotide Microarrays[J].Plant Physiology Communications,2012(9):901-908.
Authors:LI De-Jun  QIN Bi  DENG ZhiI  LIU Xiang-Hong
Institution:1Key Laboratory of Biology and Genetic Resource of Rubber Tree, Ministry of Agriculture, Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Danzhou, Hainan 571737, China," 2College of Agriculture, Hainan University, Haikou 570228, China
Abstract:
Keywords:Hevea brasiliensis  bark  molecular mechanism involved in tapping panel dryness (TPD)  TPD-re- lated genes  oligonucleotide microarrays
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