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丹参异戊烯焦磷酸异构酶基因(SmIPI)的生物信息学及表达分析
引用本文:杨滢,周露,化文平,王喆之,李翠芹.丹参异戊烯焦磷酸异构酶基因(SmIPI)的生物信息学及表达分析[J].植物生理学通讯,2011(11):1086-1090.
作者姓名:杨滢  周露  化文平  王喆之  李翠芹
作者单位:教育部药用资源与天然药物化学重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院,西安710062
基金项目:陕西师范大学中央高校基本科研业务费重点项目(GK200901014).
摘    要:异戊烯焦磷酸异构酶(IPI)是萜类合成途径的关键酶之一。本文在丹参转录组高通量数据分析的基础上,对丹参IPI基因(SmIPI)进行了克隆及序列分析。SmIPI脸长1234bp,包含681bp的开放读码框,编码226个氨基酸。生物信息学结构分析表明,SmIPI亲水性α/β蛋白,包含有IPI结构域,在序列组成、结构及活性位点等方面与其他植物的IPI均具有高度的相似性。实时荧光定量PCR分析结果表明,SmIPI在丹参生长的各个时期和不同组织器官中差异表达,其表达受病原菌和茉莉酸甲酯的诱导。

关 键 词:丹参  异戊烯焦磷酸异构酶  生物信息学分析  实时荧光定量PCR  表达模式

Bioinformatics and Expression Analysis of Isopentenyl Diphosphate Isomerase (SmlPI) from Salvia miltiorrhiza Bunge
YANG Ying,ZHOU Lu,HUA Wen-Ping,WANG Zhe-Zhi,LI Cui-Qin.Bioinformatics and Expression Analysis of Isopentenyl Diphosphate Isomerase (SmlPI) from Salvia miltiorrhiza Bunge[J].Plant Physiology Communications,2011(11):1086-1090.
Authors:YANG Ying  ZHOU Lu  HUA Wen-Ping  WANG Zhe-Zhi  LI Cui-Qin
Institution:( Key Laboratory of the Ministry of Education for Medicinal Resources and Natural Pharmaceutical Chemistry, National Engineering Laboratory for Resource Development of Endangered Crude Drugs' in Northwest of China, College of Life Sciences, Shaanxi Normal University, Xi 'an 710062, China)
Abstract:
Keywords:Salvia miltiorrhiza  isopentenyl diphosphate isomerase  bioinformatics analysis  quantitative realtime PCR  expression pattern
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