碳水化合物活性酶数据库( CAZy) 及其研究趋势简 |
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引用本文: | 王帅,陈冠军,张怀强,王禄山.碳水化合物活性酶数据库( CAZy) 及其研究趋势简[J].生物加工过程,2014(1):102-108. |
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作者姓名: | 王帅 陈冠军 张怀强 王禄山 |
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作者单位: | 山东大学 微生物技术国家重点实验室,济南250100 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划)(2011CB707401);国家自然科学基金(31070063,30970051);国家高技术研究发展计划(863计划)(2012AA10180402) |
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摘 要: | 碳水化合物活性酶数据库( CAZy)是关于能够合成或者分解复杂碳水化合物和糖复合物的酶类的一个数据库资源,其基于蛋白质结构域中的氨基酸序列相似性,将碳水化合物活性酶类归入不同蛋白质家族。 CAZy数据库中包含了碳水化合物酶类的物种来源、酶功能EC分类、基因序列、蛋白质序列及其结构等信息。而随着宏基因组学技术的快速发展,CAZy数据库中家族内序列数据量剧增,这为家族内进一步进行亚家族分类奠定了基础;而蛋白质家族内新一层精细分类的引入可提高亚家族中酶分子功能预测的准确度,进而可指导酶分子理性设计来提高特定功能酶组分设计的成功概率,从而推动生物质转化产业的发展。
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关 键 词: | 宏基因组 亚家族 功能预测 carbohydrate-active enzyme( CAZy) |
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