野生矮牡丹高通量转录组测序分析 |
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引用本文: | 黄春国,王炳华,胡桃花,韩晓丽,李文广,李萍,郝兴宇.野生矮牡丹高通量转录组测序分析[J].激光生物学报,2019,28(4):360-367. |
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作者姓名: | 黄春国 王炳华 胡桃花 韩晓丽 李文广 李萍 郝兴宇 |
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作者单位: | 山西农业大学农学院,太谷,030801;山西省农业信贷融资担保有限公司,太原,030001;山西省朔州市气象局,朔州,036000;山西农业大学林学院,太谷,030801 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;山西省重点研发计划项目;山西省科技攻关计划;山西农谷建设科研专项项目 |
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摘 要: | 为探究野生稷山矮牡丹(Paeonia jishanensis)花青素等抗氧化活性物质生物合成的遗传基础,本文采用高通量测序技术Illumina NextSeqTM500对其幼嫩叶片、嫩茎和花芽混合池样本进行转录组测序分析。共获得39450个unigene,其中3563个unigene中有4106个SSR位点。在Swiss Prot数据库中注释到29420个unigene,其中11个与花青素生物合成过程相关,22个与类黄酮生物合成过程相关,15个与异黄酮生物合成过程相关;NR数据库中注释高达100%,有12个与类黄酮生物合成相关,7个与花青素生物合成相关;GO数据库中注释到24291个unigene,分为生物学过程、细胞组分及分子功能等三大类53个功能组,有21个unigene与黄酮、黄酮醇及异黄酮生物合成有关,4个unigene与花青素合成有关;eggNOG数据库中注释到38238个unigene,涉及植物生长发育过程绝大多数生命活动过程;KEGG数据库注释到5709个unigene,分别定位到6大类别42个代谢途径,其中25个unigene与花青素生物合成相关。研究表明,在稷山矮牡丹转录组序列中,共鉴定和发掘出多个涉及类黄酮化合物生物合成、花青素生物合成过程的相关基因序列及SSR位点,为下一步开展相关代谢合成途径研究奠定了基础。
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关 键 词: | 稷山矮牡丹 转录组测序 基因分析 功能注释 |
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