| 一株褐家鼠戊型肝炎病毒的发现鉴定及系统发生分析 |
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| 引用本文： | 宗利东,殷红敏,杨银,赵维玉,徐粉慧,韩培钰,崔凤灵,何明仙,张云智.一株褐家鼠戊型肝炎病毒的发现鉴定及系统发生分析[J].激光生物学报,2023(6):548-553+560. |
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| 作者姓名： | 宗利东 殷红敏 杨银 赵维玉 徐粉慧 韩培钰 崔凤灵 何明仙 张云智 |
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| 作者单位： | 1. 大理大学公共卫生学院,大理大学预防医学研究所,云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室,云南省高校人兽共患病跨境防控与检疫重点实验室;2. 大理州第二人民医院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（U2002218,81874274）； |
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| 摘 要： | 对云南省大理市小型哺乳动物携带的戊型肝炎病毒（HEV）进行调查，用巢式RT-PCR对捕获的小型哺乳动物样品中的病毒进行检测，用高通量测序对阳性HEV样本进行毒株全基因组测序，用MEGA-X、BESTv1.10.4和Geneious软件进行生物信息学分析。本研究筛查了6属7种共114只小型哺乳动物样本，结果显示：HEV在褐家鼠中的阳性率为8.00%(2/25)；高通量测序获得1株编号为DL147的HEV全基因组，经系统发生分析确定其为HEV-C1基因型，与香港1例戊型肝炎患者血清中发现的HEV同源性最高，核苷酸序列一致性达95.21%，两株病毒的最早分歧时间约为2003年。研究证实，云南省大理市褐家鼠存在HEV-C1感染，其与近期报道的人源新发HEV高度同源，有较近的系统发生关系，对戊型肝炎防控有指导作用。
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| 关 键 词： | 戊型肝炎病毒 人兽共患病 啮齿动物 遗传分析 高通量测序 |
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