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蛋白质结构型的识别方法
引用本文:李晓琴,罗辽复.蛋白质结构型的识别方法[J].生物化学与生物物理进展,2002,29(6):938-941.
作者姓名:李晓琴  罗辽复
作者单位:内蒙古大学物理系,呼和浩特,010021
基金项目:国家自然科学基金资助项目(39960023,90103030).
摘    要:给出了α型、β型、α/β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律.提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别(分类)的方法.以蛋白质二级结构主序列三联体为参数,利用Mahalanobis距离方法对上述4种结构型的蛋白质进行识别,分类的总体准确率为81%;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源,利用多样性增量极小化对上述4种结构型进行识别,分类的总体准确率为83%. 同时也给出了对紧结构域的识别途径.

关 键 词:蛋白质结构型    二级结构序列    多样性指标
收稿时间:2002/6/21 0:00:00
修稿时间:8/2/2002 12:00:00 AM

The Recognition of Protein Structural Class
LI Xiao-Qin and LUO Liao-Fu.The Recognition of Protein Structural Class[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2002,29(6):938-941.
Authors:LI Xiao-Qin and LUO Liao-Fu
Institution:Department of Physics, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China;Department of Physics, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China
Abstract:
Keywords:protein structural class  secondary structure sequence  diversity measure
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