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酵母基因中转录正调控内含子序列特征的统计分析
引用本文:张静,石秀凡.酵母基因中转录正调控内含子序列特征的统计分析[J].生物化学与生物物理进展,2003,30(2):231-238.
作者姓名:张静  石秀凡
作者单位:1. 云南大学应用统计中心,昆明,650091
2. 中国科学院昆明动物研究所,细胞与分子进化重点实验室,昆明,650223
基金项目:教育部科研重点基金资助项目(00246).
摘    要:大量实验研究显示,真核基因的许多内含子具有调控转录的功能,但是对此问题尚缺乏全面的研究.观察一些酵母基因的转录频率与基因的内含子序列后,发现一个值得注意的现象:转录频率高的基因内含子序列一般都比较长,而转录频率低的基因内含子一般都比较短.这提示高效转录基因的较长内含子中可能含有某些增强基因转录的特征性结构.于是选取两组酵母基因的内含子进行详细研究,第一组的基因具有较高的转录频率(>30),第二组的基因转录频率较低(≤10).对寡核苷酸(主要是四核苷酸、五核苷酸)的出现频率进行统计比较分析,探测到一批寡核苷酸,它们在第一组内含子中出现的频率显著高于在第二组内含子中出现的频率,同时也显著高于与第一组内含子相邻的外显子中的出现频率.其中一些寡核苷酸与实验研究得到的转录调控元件相同.从这批寡核苷酸在内含子和外显子序列中的分布看,高效转录基因内含子的序列结构确实有利于基因的转录.

关 键 词:酵母,内含子,基因转录频率,寡核苷酸出现频率
收稿时间:2002/9/28 0:00:00
修稿时间:2002年9月28日
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