| 一种从多表达谱数据挖掘基因共表达团的新方法 |
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| 引用本文： | 陈兰,王世敏,陈润生.一种从多表达谱数据挖掘基因共表达团的新方法[J].生物化学与生物物理进展,2008,35(8):914-920. |
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| 作者姓名： | 陈兰 王世敏 陈润生 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院计算技术研究所,北京,100190;中国科学院研究生院,北京,100049
2. 中国科学院计算技术研究所,北京,100190;中国科学院生物物理研究所,北京,100101 |
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| 摘 要： | 随着近年来高通量基因表达谱数据的涌现，集成多个不同实验条件的表达谱数据，并挖掘在多数据源都保守的基因共表达团，成为预测基因功能或者调控关系的方法之一．但是，常用的方法通常仅简单地集成不同表达谱数据并推导保守基因共表达团，这样可能会导致结果中出现并非真正在多数据源保守的共表达团．提出一种结合最小哈希与局部敏感哈希的新方法，可以高效地寻找在多表达谱数据源中真正保守的基因共表达团．结果分析证明，相比过去的方法，现提出的方法可以获得更加功能相关和调控相关的基因共表达团．
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| 关 键 词： | 表达谱 共表达网络 最小哈希 局部敏感哈希 |
| 收稿时间： | 1/7/2008 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 3/4/2008 12:00:00 AM |
A Method to Detect Gene Co-expression Clusters From Multiple Microarrays |
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| CHEN Lan,WANG Shi-Min and CHEN Run-Sheng.A Method to Detect Gene Co-expression Clusters From Multiple Microarrays[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2008,35(8):914-920. |
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| Authors: | CHEN Lan WANG Shi-Min and CHEN Run-Sheng |
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| Institution: | Bioinformatics Research Group, Institute of Computing Technology, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China; Graduate School of The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China;Bioinformatics Research Group, Institute of Computing Technology, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China; Graduate School of The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China;Bioinformatics Research Group, Institute of Computing Technology, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China; Bioinformatics Laboratory, Institute of Biophysics, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | microarray co-expression network min-hashing locality-sensitive hashing |
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