首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
   检索      

基于皮肤组织转录组学和蛋白质组学测序揭示影响羊毛性状的关键基因(英文)
引用本文:吴晋强,郝晓静,赵红霞,董亚洁,王荣,张鹏翔,王海东,赫晓燕.基于皮肤组织转录组学和蛋白质组学测序揭示影响羊毛性状的关键基因(英文)[J].生物化学与生物物理进展,2023,50(3):606-622.
作者姓名:吴晋强  郝晓静  赵红霞  董亚洁  王荣  张鹏翔  王海东  赫晓燕
作者单位:山西农业大学动物医学学院,太谷 030801,山西农业大学动物医学学院,太谷 030801,山西农业大学动物医学学院,太谷 030801,山西农业大学动物医学学院,太谷 030801,山西农业大学动物医学学院,太谷 030801,山西农业大学动物医学学院,太谷 030801,山西农业大学动物医学学院,太谷 030801,山西农业大学动物医学学院,太谷 030801
基金项目:国家自然科学基金(31772690)和山西省自然科学基金(201701D121106)资助项目。
摘    要:目的 羊毛是高档纺织原料,羊毛的物理性质直接关系到羊毛品质。本研究旨在挖掘影响羊毛性状的基因,探索影响羊毛性状的复杂分子机制。方法 本研究选取萨福克羊和小尾寒羊各3只作为试验样本,取背部皮肤组织,采用转录组学(RNA-seq)和蛋白质组学测序分析造成羊毛性状差异的基因、蛋白质及相关信号通路。结果 转录组测序表明:测序完成后,共得到230 406 674个原始数据和222 049 370个干净数据,其中Q20碱基百分比为99.9%以上,Q30碱基百分比为98%以上。以差异倍数FC≥1.4或FC≤0.714且P<0.05作为标准,由此筛选出1 213个差异表达基因(DEGs),其中萨福克羊与小尾寒羊相比,上调基因有644个,下调基因有569个。GO富集发现中间丝、钙离子结合、角蛋白丝显著富集,表明其可能与羊毛性状相关。KEGG富集发现,影响羊毛性状的信号通路可能是ECM-受体相互作用。蛋白质组测序表明:以差异倍数FC≥1.4或FC≤0.714且P<0.05作为标准,由此筛选出99个差异表达蛋白(DEPs),其中萨福克羊与小尾寒羊相比,上调蛋白有47个,下调蛋白有52个。GO富集...

关 键 词:转录组测序  蛋白质组测序  萨福克羊  小尾寒羊  羊毛性状
收稿时间:2022/5/31 0:00:00
修稿时间:2023/3/8 0:00:00

Revealing The Key Genes Affecting Wool Traits on The Basis of Skin Tissue RNA-seq and Proteome Sequencing
WU Jin-Qiang,HAO Xiao-Jing,ZHAO Hong-Xi,DONG Ya-Jie,WANG Rong,ZHANG Peng-Xiang,WANG Hai-Dong and HE Xiao-Yan.Revealing The Key Genes Affecting Wool Traits on The Basis of Skin Tissue RNA-seq and Proteome Sequencing[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2023,50(3):606-622.
Authors:WU Jin-Qiang  HAO Xiao-Jing  ZHAO Hong-Xi  DONG Ya-Jie  WANG Rong  ZHANG Peng-Xiang  WANG Hai-Dong and HE Xiao-Yan
Institution:College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China,College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China,College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China,College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China,College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China,College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China,College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China,College of Animal Medicine, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China
Abstract:
Keywords:RNA-sequencing  proteome sequencing  Suffolk sheep  small-tailed Han sheep  wool traits
点击此处可从《生物化学与生物物理进展》浏览原始摘要信息
点击此处可从《生物化学与生物物理进展》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号