| 线虫体内新piRNA研究 |
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| 引用本文： | 崔东亚,王佳佳,孙旭滨,张鹏,何顺民,黄大卫.线虫体内新piRNA研究[J].生物化学与生物物理进展,2014,41(12):1228-1234. |
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| 作者姓名： | 崔东亚 王佳佳 孙旭滨 张鹏 何顺民 黄大卫 |
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| 作者单位： | 河北大学生命科学学院，保定 071000；中国科学院动物研究所系统与进化重点实验室，北京 100101；运城学院生命科学系，运城 044000,河北大学生命科学学院，保定 071000；中国科学院动物研究所系统与进化重点实验室，北京 100101,河北大学生命科学学院，保定 071000；中国科学院动物研究所系统与进化重点实验室，北京 100101,中国科学院动物研究所系统与进化重点实验室，北京 100101,中国科学院动物研究所系统与进化重点实验室，北京 100101,河北大学生命科学学院，保定 071000；中国科学院动物研究所系统与进化重点实验室，北京 100101 |
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| 摘 要： | PIWI-interacting RNAs(piRNA)是一类內源性小RNA,负责抵御转座子和转基因对基因组的入侵.已发现1.6万多种piRNA,在piRNA上游存在保守序列,根据上游序列特征可以预测新的piRNA.将线虫同步化培养至L4时期,分别提取野生和prg-1突变样本中的小RNA,并对其进行高通量测序.基于piRNA上游保守序列特征,在野生线虫L4时期中,发现了967种新piRNA,这些新piRNA在prg-1突变后表达消失.新piRNA的基因座集中分布在四号染色体的2个piRNA簇内,首位碱基以U为主.与已发表的成虫发育时期的PRG-1免疫共沉淀数据比对,发现有153种piRNA存在于与PRG-1免疫沉淀的数据中.同时还发现一些只在野生线虫中表达的non-21nt小RNA,它们与已知piRNA的基因座相同,推测这些non-21nt小RNA可能是其piRNA前体加工的产物.总之,通过小RNA测序,在线虫中发现了一些新的piRNA.
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| 关 键 词： | 线虫 pi RNA 预测 新pi RNA PRG- |
| 收稿时间： | 2014/3/14 0:00:00 |
| 修稿时间： | 8/3/2014 12:00:00 AM |
The Research of Caenorhabditis elegans New piRNAs |
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| CUI Dong-Y,WANG Jia-Ji,SUN Xu-Bin,ZHANG Peng,HE Shun-Min and huangdawei.The Research of Caenorhabditis elegans New piRNAs[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2014,41(12):1228-1234. |
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| Authors: | CUI Dong-Y WANG Jia-Ji SUN Xu-Bin ZHANG Peng HE Shun-Min and huangdawei |
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| Institution: | College of Life Science, Hebei University, Baoding 071002, China;Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;College of Life Science, Yuncheng University, Yuncheng 044000, China,College of Life Science, Hebei University, Baoding 071002, China;Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China,College of Life Science, Hebei University, Baoding 071002, China;Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China,Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China,Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China and College of Life Science, Hebei University, Baoding 071002, China;Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Caenorhabditis elegans piRNA prediction new piRNA PRG-1 |
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