| 新基因水稻 OsLSD1 的克隆及拟南芥和水稻类 LSD1 基因家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王丽娟,田颖川,何朝族.新基因水稻 OsLSD1 的克隆及拟南芥和水稻类 LSD1 基因家族的生物信息学分析[J].生物化学与生物物理进展,2005,32(3):268-274. |
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| 作者姓名： | 王丽娟 田颖川 何朝族 |
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| 作者单位： | 1) 中国科学院微生物研究所，植物基因组学国家重点实验室，北京 100080 ； 2) 中国科学院研究生院，北京 100039;中国科学院微生物研究所，植物基因组学国家重点实验室，北京 100080;中国科学院微生物研究所，植物基因组学国家重点实验室，北京 100080 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展规划项目(973)(G2000016203)和国家自然科学基金资助项目(30270706). |
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| 摘 要： | 类 LSD1 (LSD1-like) 基因家族是一类特殊的 C2C2 型锌指蛋白基因，编码植物特有的转录因子 . 目前已经研究的 2 个成员拟南芥 LSD1 (lesions stimulating disease resistance 1) 和 LOL1 (LSD-One-Like 1) 基因均参与植物细胞程序化死亡 (programmed cell death, PCD) 的调控 . 从水稻 cDNA 文库中克隆到 1 个类 LSD1 基因，命名为 OsLSD1. 该基因长 988 bp ，包含一个 432 bp 的开放阅读框，推导的氨基酸序列 (143 个氨基酸 ) 含有 3 个内部保守的锌指结构域 . DNA 印迹结果表明 OsLSD1 基因在水稻基因组中为单拷贝，且在根、茎和叶中表达 . 借助于生物信息学分析技术，从拟南芥和水稻数据库中各识别出 5 个和 7 个 ( 包括 OsLSD1) 类 LSD1 基因 . 分析了这些类 LSD1 基因的结构，蛋白质结构域组成 . 系统进化分析表明，无论基于编码区的核苷酸或氨基酸序列都可以将这些类 LSD1 基因分为 2 类 . 虽然不存在拟南芥或水稻特有的类 LSD1 蛋白，但有些结构域是水稻所特有的，也有些基因是来源于复制事件 .
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| 关 键 词： | 类 LSD1 基因，锌指结构域，细胞程序化死亡 (PCD) ，系统发生，基因复制 |
Cloning of a Novel Rice Gene OsLSD1 and Bioinformatic Analysis of LSD1-like Gene Family From Arabidopsis and Rice |
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| WANG Li-Juan,TIAN Ying-Chuan and HE Chao-Zu.Cloning of a Novel Rice Gene OsLSD1 and Bioinformatic Analysis of LSD1-like Gene Family From Arabidopsis and Rice[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2005,32(3):268-274. |
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| Authors: | WANG Li-Juan TIAN Ying-Chuan and HE Chao-Zu |
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| Institution: | 1)National Key Laboratory of Plant Genomics, Institute of Microbiology, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080, China; 2)Graduate School of The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100039, China;National Key Laboratory of Plant Genomics, Institute of Microbiology, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080, China;National Key Laboratory of Plant Genomics, Institute of Microbiology, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | LSD1-like gene zinc finger domain programmed cell death (PCD) phylogenetic analysis gene duplication |
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