| 基于RNA-Seq的长非编码RNA预测 |
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| 引用本文： | 孙磊,张林,刘辉.基于RNA-Seq的长非编码RNA预测[J].生物化学与生物物理进展,2012,39(12):1156-1166. |
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| 作者姓名： | 孙磊 张林 刘辉 |
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| 作者单位： | 中国矿业大学信息与电气工程学院;中国科学院北京基因组研究所计算生物学研究中心 |
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| 基金项目： | 中国博士后科学基金资助项目(2012M511335,2012M511336);中央高校基本科研业务费专项基金资助项目(2010QNA47,2010QNA50);霍英东教育基金会青年教师基金资助项目(121066)~~ |
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| 摘 要： | 随着新一代生物技术和生物信息学的发展,研究发现,在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA(long non-codingRNA,lncRNA),而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的功能作用.当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术,并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析,以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功能等信息.本文将对基于RNA-Seq的lncRNA预测流程进行介绍,对其中涉及的生物信息学方法进行较为全面的综述,就相关问题和挑战展开讨论,并对研究进行展望.
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| 关 键 词： | 长非编码RNA RNA-Seq lncRNA预测 生物信息学 |
| 收稿时间： | 6/12/2012 5:25:35 PM |
| 修稿时间： | 8/6/2012 11:45:11 AM |
Prediction of Long Non-Coding RNAs Based on RNA-Seq |
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| SUN Lei,ZHANG Lin and LIU Hui.Prediction of Long Non-Coding RNAs Based on RNA-Seq[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2012,39(12):1156-1166. |
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| Authors: | SUN Lei ZHANG Lin and LIU Hui |
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| Institution: | 1)**(1) School of Information and Electrical Engineering,China University of Mining and Technology,Xuzhou 221008,China; 2) Center for Computational Biology,Beijing Institute of Genomics,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100029,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | long non-coding RNA RNA-Seq lncRNA prediction bioinformatics |
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