蛋白质结构型的定义和识别 |
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引用本文: | 李晓琴,罗辽复.蛋白质结构型的定义和识别[J].生物化学与生物物理进展,2002,29(1). |
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作者姓名: | 李晓琴 罗辽复 |
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作者单位: | 内蒙古大学理工学院,呼和浩特,010021 |
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摘 要: | 提出紧结构域的概念,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域.利用3种紧结构域(α域,β域和α/β域)定义球蛋白的5种结构型:α型蛋白,β型蛋白,α/β型蛋白,多域蛋白和ζ型蛋白.将1 261个代表性的蛋白质(1 022家族)进行分类,并和SCOP库的分类做了比较.进行了删去序列冗余的分析.在此基础上提出结构型的预测方案,成功率在82%~85%.
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关 键 词: | 蛋白质的结构型 二级结构序列 紧结构域 序列冗余 预测 |
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