| 人类新基因C17orf32的电子克隆和编码区序列RT-PCR验证 |
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| 引用本文： | 张德礼,丁培国,凌伦奖,陈润生,马大龙.人类新基因C17orf32的电子克隆和编码区序列RT-PCR验证[J].生物化学与生物物理进展,2002,29(4):543-549. |
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| 作者姓名： | 张德礼 丁培国 凌伦奖 陈润生 马大龙 |
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| 作者单位： | 1. 北京大学人类疾病基因研究中心,国家人类基因组北方研究中心,北京,100083
2. 中国科学院生物物理研究所,北京,100101 |
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| 基金项目： | 中国博士后科学基金资助项目（2920011217608062000）. |
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| 摘 要： | 利用生物信息学与实验验证的技术路线，成功地克隆了人类新基因C17orf32的cDNA(GenBank登记号：AY074907和TPA: BK000260)，发现C17orf32的完整开放阅读框架(ORF，31～657 bp）cDNA（627 bp）与人类假定基因LOC124919 ORF(25～807 bp)的25～651位只有一个碱基不同.经RT-PCR验证并cDNA测序、人类表达序列标签(EST)数据库的BLAST检索和基因组成规律分析三方面的结果，均支持C17orf32的序列，而不支持LOC124919的编码序列.C17orf32基因组序列全长4.610 kb，含有6个外显子和5个内含子，cDNA序列全长1 679 bp, ORF横跨全部6个外显子.该基因ORF翻译起始处符合Kozak规则，ORF起始码上游同一相位有终止码，ORF后有2个加尾信号和PolyA尾.C17orf32基因的成功克隆表明，NCBI GENOME Annotation Project在2001年12月预测的人类假定蛋白XP-058865编码基因LOC124919的模式参考序列XM-058865中存在偏差，即在C17orf32基因cDNA的406与407位碱基之间错误插入一个碱基G, 从而导致在插入位点后，ORF编码125位氨基酸以后蛋白质序列的改变，出现260个氨基酸的多肽.因此，应慎重看待计算机注释的人类基因组编码序列.建立的技术路线有助于发现更多新的人类功能基因.
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| 关 键 词： | C17orf32，LOC124919，XM-058865，XP-058865，生物信息学，电子克隆，RT-PCR，人类基因组注释 |
| 收稿时间： | 3/8/2002 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2002年3月8日 |
In Silico Cloning of C17orf32, a Novel Human Gene and Verification of Its Coding Region by RT-PCR |
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| ZHANG De-Li,DING Pei-Guo,LING Lun-Jiang,CHEN Run-Sheng and MA Da-Long.In Silico Cloning of C17orf32, a Novel Human Gene and Verification of Its Coding Region by RT-PCR[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2002,29(4):543-549. |
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| Authors: | ZHANG De-Li DING Pei-Guo LING Lun-Jiang CHEN Run-Sheng and MA Da-Long |
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| Institution: | Peking University Center for Human Disease Genomics, China National Center for Human Genome Research, Beijing 100083, China;Peking University Center for Human Disease Genomics, China National Center for Human Genome Research, Beijing 100083, China;Institute of Biophysics, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;Institute of Biophysics, The Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;Peking University Center for Human Disease Genomics, China National Center for Human Genome Research, Beijing 100083, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | C17orf32 LOC124919 XM-058865 XP-058865 bioinformatics in silico cloning RT-PCR human genome annotation |
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