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人PRL-3基因启动子的克隆及转录因子Snail结合位点的初步鉴定
引用本文:周军,李建明,杨发达,柳玉红,丁彦青.人PRL-3基因启动子的克隆及转录因子Snail结合位点的初步鉴定[J].生物化学与生物物理进展,2008,35(2):187-194.
作者姓名:周军  李建明  杨发达  柳玉红  丁彦青
作者单位:南方医科大学南方医院病理科,广州,510515;南方医科大学基础医学院病理学教研室,广州,510515;广东省分子肿瘤病理重点实验室,广州,510515;教育部广东省共建人类重大疾病转录组学和蛋白质组学重点实验室,广州,510515
摘    要:促肝细胞再生磷酸酶-3(PRL-3)是重要的肿瘤转移相关基因,其转录调控机制一直未被阐明.应用TRED在线分析系统共获得3种可能的人PRL-3基因启动子区域.通过与人基因组序列进行比对,发现其中3号启动子序列距离人PRL-3基因距离最近,位于该基因上游约1 kb的DNA区域,与5′端非翻译区域邻接.在线Consite分析系统发现,-500 bp至-451bp之间存在Snail结合的核心寡核苷酸序列CACCTG.运用分子克隆的方法获得PRL-3基因启动子2段区域-699 bp至299bp及-642 bp至-383 bp区域,后者具有Snail结合位点核心寡核苷酸序列CACCTG.构建具有荧光素酶报告基因的pGL3载体并检测其启动子活性.-699~299 bp区域与-642~-383 bp区域的DNA片段在SW480、SW620、CNE2、293A细胞中均具有启动子活性,其中含有Snail结合位点核心寡核苷酸序列CACCTG的短片段活性强于较完整的序列.染色质免疫沉淀结合PCR扩增技术及凝胶迁移阻滞实验确定PRL-3基因启动子区域具有Snail结合位点.研究确定,PRL-3基因的启动子位于转录起始位点上游700 bp与下游300 bp的DNA区域,PRL-3基因启动子存在转录因子Snail结合元件.

关 键 词:PRL-3  启动子  Snail  转录调控  基因启动子  分子克隆  转录因子  Snail  结合位点  Binding  Site  Identification  Promoter  Gene  Human  结合元件  转录起始位点  研究  实验确定  阻滞  凝胶迁移  扩增技术  染色质免疫沉淀  寡核苷酸序列  启动子活性
收稿时间:2007-06-07
修稿时间:2007-11-07

Cloning of Human PRL-3 Gene Promoter and Preliminary Identification of Its Snail Binding Site
ZHOU Jun,LI Jian-Ming,YANG Fa-D,LIU Yu-Hong and DING Yan-Qing.Cloning of Human PRL-3 Gene Promoter and Preliminary Identification of Its Snail Binding Site[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2008,35(2):187-194.
Authors:ZHOU Jun  LI Jian-Ming  YANG Fa-D  LIU Yu-Hong and DING Yan-Qing
Institution:Department of Pathology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Department of Pathology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Department of Pathology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Department of Pathology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Department of Pathology, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China
Abstract:
Keywords:PRL-3  PRL-3 promoter  promoter activity  Snail  regulatory elements
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