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TCR-CD3复合物跨膜区自组装的分子机制
引用本文:王凤丽,陈佳林,何程智,罗施中.TCR-CD3复合物跨膜区自组装的分子机制[J].生物化学与生物物理进展,2022,49(6):1094-1102.
作者姓名:王凤丽  陈佳林  何程智  罗施中
作者单位:北京化工大学生命科学与技术学院,北京软物质科学与工程高精尖创新中心,北京 100029,北京化工大学生命科学与技术学院,北京软物质科学与工程高精尖创新中心,北京 100029,北京化工大学生命科学与技术学院,北京软物质科学与工程高精尖创新中心,北京 100029,北京化工大学生命科学与技术学院,北京软物质科学与工程高精尖创新中心,北京 100029
基金项目:国家自然科学基金(22077010,11902023)和天津大学精密测试技术及仪器国家重点实验室开放课题(pilab1902)资助项目。
摘    要:目的 T细胞受体-共受体复合物(TCR-CD3)在适应性免疫应答中起着重要作用,其亚基间的相互作用一直是研究热点。由于传统实验的局限性,对于跨膜蛋白TCR-CD3复合物的研究不能深入到微观层面。方法 利用分子动力学模拟方法(包括粗粒化模拟、拉伸动力学、全原子模拟)分析TCR-CD3复合物的自组装机制。结果 通过粗粒化模拟(CGMD)发现,TCR-CD3复合物在组装过程中存在着αβ依次结合δε’、γε、ζζ’的组装顺序,并阐述了αR253突变会降低αK258与δε’的相互作用。结论 本文论证了仅存在TCR-CD3复合物的跨膜区不足以介导TCR-CD3复合物亚基间的特异性相互作用。拉伸动力学(SMD)和全原子模拟(AAMD)的结果说明,ζζ’与TCR-CD3其余部分之间的胞外区相互作用强于跨膜区,同时ζζ’的缺失对αβδε’γε的稳定性影响最小,而δε’的缺失对αβγεζζ’的稳定性影响最大。

关 键 词:TCR-CD3复合物  粗粒化模拟  全原子模拟  拉伸动力学模拟  跨膜蛋白
收稿时间:2021/5/11 0:00:00
修稿时间:2021/8/3 0:00:00

The Molecular Mechanism of TCR-CD3 Complex Self-assembly
WANG Feng-Li,CHEN Jia-Lin,HE Cheng-Zhi and LUO Shi-Zhong.The Molecular Mechanism of TCR-CD3 Complex Self-assembly[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2022,49(6):1094-1102.
Authors:WANG Feng-Li  CHEN Jia-Lin  HE Cheng-Zhi and LUO Shi-Zhong
Institution:Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China,Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China,Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China,Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China
Abstract:
Keywords:TCR-CD3 complex  coarse-grained simulation  all-atom simulation  steered dynamics  transmembrane protein
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