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IGFBP2基因3′UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析
引用本文:于莹莹,乔书培,孙婴宁,宋鹤,张潇飞,闫晓红,李辉,王宁.鸡IGFBP2基因3′UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析[J].生物化学与生物物理进展,2014,41(11):1163-1172.
作者姓名:于莹莹  乔书培  孙婴宁  宋鹤  张潇飞  闫晓红  李辉  王宁
作者单位:农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030;齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,齐齐哈尔 161006,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973)(2009CB941604),国家肉鸡产业技术体系建设(CARS-42)和国家自然科学基金( 31372299)资助项目
摘    要:鸡IGFBP2基因3′非编码区(3′UTR)1196CA单核苷酸多态性(SNP)与鸡的腹脂重和腹脂率显著相关.生物信息学分析显示,该SNP恰好位于gga-mi R-456-3p的一个潜在靶基因结合位点处,提示IGFBP2基因可能是gga-mi R-456-3p的一个靶基因,且该SNP位点可能影响gga-mi R-456-3p对IGFBP2基因表达的调控作用.为鉴定SNP 1196CA是否为功能性SNP,本研究分别构建了包含该SNP位点C或A等位基因的双荧光素酶报告基因载体,比较分析这两个等位基因在鸡胚成纤维细胞系(DF1)和鸡前脂肪细胞中对报告基因活性和表达的影响;利用mi RNA mimics和inhibitor分析gga-mi R-456-3p对不同等位基因报告基因活性以及内源性IGFBP2表达的影响.结果发现,在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中,A等位基因的报告基因活性和表达均显著高于C等位基因(P0.05);gga-mi R-456-3p仅影响C等位基因的报告基因活性和表达,而对A等位基因的报告基因活性没有明显影响;gga-mi R-456-3p调控细胞内源性IGFBP2基因的m RNA和蛋白质表达.本研究证实IGFBP2基因是gga-mi R-456-3p的靶基因,其3′UTR区SNP 1196CA是一个功能性SNP,它影响gga-mi R-456-3p对鸡IGFBP2基因的表达调控作用.本研究结果对于鸡的分子辅助选择育种及IGFBP2基因在脂肪沉积中调控机制的阐明具有重要意义.

关 键 词:  IGFBP基因  单核苷酸多态性  ′非编码区  gga-mi  R--p
收稿时间:3/7/2014 12:00:00 AM
修稿时间:2014/6/13 0:00:00
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