| 核小体定位与RNA剪接 |
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| 引用本文： | 陈伟,罗辽复,张利绒,邢永强.核小体定位与RNA剪接[J].生物化学与生物物理进展,2009,36(8):1035-1040. |
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| 作者姓名： | 陈伟 罗辽复 张利绒 邢永强 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学物理科学与技术学院,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(90403010, 10447003) |
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| 摘 要： | 根据核小体定位序列和缺失序列的碱基分布特征，应用多样性增量二次判别方法(IDQD)构建模型对这两类序列进行了区分，受试者操作特性曲线下的面积达到了0.958．应用这一模型研究了核小体在人类基因组剪接位点(GT/AG)邻近序列中的分布方式，发现外显子所对应的DNA序列通常倾向参与核小体的形成，并且由它所转录的RNA统计上具有较强的刚性，而剪接位点及其邻近的内含子对应的DNA序列则避免参与核小体的形成，所转录的RNA统计上具有较强的柔性．进一步还发现，DNA序列的核小体定位/缺失和RNA的刚性/柔性具有统计相关性，为从机制上解释为何前体RNA剪接事件与DNA序列中的核小体定位信息有关提供了依据．
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| 关 键 词： | 多样性增量二次判别方法，核小体定位，剪接位点，RNA柔性 |
| 收稿时间： | 2008/11/27 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2009/2/19 0:00:00 |
Nucleosome positioning and RNA splicing |
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| CHEN Wei,LUO Liao-Fu,ZHANG Li-Rong and XING Yong-Qiang.Nucleosome positioning and RNA splicing[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2009,36(8):1035-1040. |
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| Authors: | CHEN Wei LUO Liao-Fu ZHANG Li-Rong and XING Yong-Qiang |
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| Institution: | School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China;School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China;School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China;School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | increment of diversity with quadratic discriminant analysis nucleosome positioning splice sites RNA flexibility |
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