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蛋白质结构型的定义和识别
引用本文:李晓琴,罗辽复.蛋白质结构型的定义和识别[J].生物化学与生物物理进展,2002,29(1):124-127.
作者姓名:李晓琴  罗辽复
作者单位:内蒙古大学理工学院,呼和浩特,010021
基金项目:国家自然科学基金资助项目(39960023).
摘    要:提出紧结构域的概念,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域.利用3种紧结构域(α域,β域和α/β域)定义球蛋白的5种结构型:α型蛋白,β型蛋白,α/β型蛋白,多域蛋白和ζ型蛋白.将1 261个代表性的蛋白质(1 022家族)进行分类,并和SCOP库的分类做了比较.进行了删去序列冗余的分析.在此基础上提出结构型的预测方案,成功率在82%~85%.

关 键 词:蛋白质的结构型,二级结构序列,紧结构域,序列冗余,预测
收稿时间:2001/5/14 0:00:00
修稿时间:2001年5月14日

The Definition and Recognition of Protein Structural Class
LI Xiao-Qin and LUO Liao-Fu.The Definition and Recognition of Protein Structural Class[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2002,29(1):124-127.
Authors:LI Xiao-Qin and LUO Liao-Fu
Institution:Laboratory of Theoretical Biophysics, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China;Laboratory of Theoretical Biophysics, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China
Abstract:
Keywords:protein structural class  secondary structure sequence  compact structural domain  sequence redundancy  prediction
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